TRPM7

TRPM7
Ідентифікатори
Символи TRPM7, ALSPDC, CHAK, CHAK1, LTRPC7, LTrpC-7, TRP-PLIK, transient receptor potential cation channel subfamily M member 7
Зовнішні ІД OMIM: 605692 MGI: 1929996 HomoloGene: 9774 GeneCards: TRPM7
Пов'язані генетичні захворювання
Lytico-bodig disease[1]
Реагує на сполуку
циклічний аденозинмонофосфат, Аденозинтрифосфат, гідрон, nafamostat[2]
Онтологія гена
Молекулярна функція

transferase activity
nucleotide binding
myosin binding
зв'язування з іоном металу
kinase activity
protein serine/threonine kinase activity
ion channel activity
actin binding
ATP binding
calcium channel activity

Клітинна компонента

integral component of membrane
мембрана
ruffle
клітинна мембрана

Біологічний процес

cellular magnesium ion homeostasis
calcium-dependent cell-matrix adhesion
GO:0010703, GO:0010702 запрограмована клітинна смерть
фосфорилювання
actomyosin structure organization
cation transport
ion transport
protein tetramerization
protein phosphorylation
calcium ion transmembrane transport
protein autophosphorylation
GO:0060554, GO:0060555 Некроптоз
calcium ion transport
трансмембранний транспорт

Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
54822
58800
Ensembl
ENSG00000092439
ENSMUSG00000027365
UniProt
Q96QT4
Q923J1
RefSeq (мРНК)
NM_001301212
NM_017672
NM_001164325
NM_021450
RefSeq (білок)
NP_001288141
NP_060142
NP_001157797
NP_067425
Локус (UCSC) Хр. 15: 50.55 – 50.69 Mb Хр. 2: 126.63 – 126.72 Mb
PubMed search [3] [4]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

TRPM7 (англ. Transient receptor potential cation channel subfamily M member 7) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми. [5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 865 амінокислот, а молекулярна маса — 212 697[6].

Послідовність амінокислот
1020304050
MSQKSWIESTLTKRECVYIIPSSKDPHRCLPGCQICQQLVRCFCGRLVKQ
HACFTASLAMKYSDVKLGDHFNQAIEEWSVEKHTEQSPTDAYGVINFQGG
SHSYRAKYVRLSYDTKPEVILQLLLKEWQMELPKLVISVHGGMQKFELHP
RIKQLLGKGLIKAAVTTGAWILTGGVNTGVAKHVGDALKEHASRSSRKIC
TIGIAPWGVIENRNDLVGRDVVAPYQTLLNPLSKLNVLNNLHSHFILVDD
GTVGKYGAEVRLRRELEKTINQQRIHARIGQGVPVVALIFEGGPNVILTV
LEYLQESPPVPVVVCEGTGRAADLLAYIHKQTEEGGNLPDAAEPDIISTI
KKTFNFGQNEALHLFQTLMECMKRKELITVFHIGSDEHQDIDVAILTALL
KGTNASAFDQLILTLAWDRVDIAKNHVFVYGQQWLVGSLEQAMLDALVMD
RVAFVKLLIENGVSMHKFLTIPRLEELYNTKQGPTNPMLFHLVRDVKQGN
LPPGYKITLIDIGLVIEYLMGGTYRCTYTRKRFRLIYNSLGGNNRRSGRN
TSSSTPQLRKSHESFGNRADKKEKMRHNHFIKTAQPYRPKIDTVMEEGKK
KRTKDEIVDIDDPETKRFPYPLNELLIWACLMKRQVMARFLWQHGEESMA
KALVACKIYRSMAYEAKQSDLVDDTSEELKQYSNDFGQLAVELLEQSFRQ
DETMAMKLLTYELKNWSNSTCLKLAVSSRLRPFVAHTCTQMLLSDMWMGR
LNMRKNSWYKVILSILVPPAILLLEYKTKAEMSHIPQSQDAHQMTMDDSE
NNFQNITEEIPMEVFKEVRILDSNEGKNEMEIQMKSKKLPITRKFYAFYH
APIVKFWFNTLAYLGFLMLYTFVVLVQMEQLPSVQEWIVIAYIFTYAIEK
VREIFMSEAGKVNQKIKVWFSDYFNISDTIAIISFFIGFGLRFGAKWNFA
NAYDNHVFVAGRLIYCLNIIFWYVRLLDFLAVNQQAGPYVMMIGKMVANM
FYIVVIMALVLLSFGVPRKAILYPHEAPSWTLAKDIVFHPYWMIFGEVYA
YEIDVCANDSVIPQICGPGTWLTPFLQAVYLFVQYIIMVNLLIAFFNNVY
LQVKAISNIVWKYQRYHFIMAYHEKPVLPPPLIILSHIVSLFCCICKRRK
KDKTSDGPKLFLTEEDQKKLHDFEEQCVEMYFNEKDDKFHSGSEERIRVT
FERVEQMCIQIKEVGDRVNYIKRSLQSLDSQIGHLQDLSALTVDTLKTLT
AQKASEASKVHNEITRELSISKHLAQNLIDDGPVRPSVWKKHGVVNTLSS
SLPQGDLESNNPFHCNILMKDDKDPQCNIFGQDLPAVPQRKEFNFPEAGS
SSGALFPSAVSPPELRQRLHGVELLKIFNKNQKLGSSSTSIPHLSSPPTK
FFVSTPSQPSCKSHLETGTKDQETVCSKATEGDNTEFGAFVGHRDSMDLQ
RFKETSNKIKILSNNNTSENTLKRVSSLAGFTDCHRTSIPVHSKQAEKIS
RRPSTEDTHEVDSKAALIPDWLQDRPSNREMPSEEGTLNGLTSPFKPAMD
TNYYYSAVERNNLMRLSQSIPFTPVPPRGEPVTVYRLEESSPNILNNSMS
SWSQLGLCAKIEFLSKEEMGGGLRRAVKVQCTWSEHDILKSGHLYIIKSF
LPEVVNTWSSIYKEDTVLHLCLREIQQQRAAQKLTFAFNQMKPKSIPYSP
RFLEVFLLYCHSAGQWFAVEECMTGEFRKYNNNNGDEIIPTNTLEEIMLA
FSHWTYEYTRGELLVLDLQGVGENLTDPSVIKAEEKRSCDMVFGPANLGE
DAIKNFRAKHHCNSCCRKLKLPDLKRNDYTPDKIIFPQDEPSDLNLQPGN
STKESESTNSVRLML

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, іонних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, транспорт кальцію. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном цинку, іоном кальцію. Локалізований у мембрані.

Література

  • Ryazanova L.V., Dorovkov M.V., Ansari A., Ryazanov A.G. (2004). Characterization of the protein kinase activity of TRPM7/ChaK1, a protein kinase fused to the transient receptor potential ion channel. J. Biol. Chem. 279: 3708—3716. PMID 14594813 DOI:10.1074/jbc.M308820200
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Dorovkov M.V., Ryazanov A.G. (2004). Phosphorylation of annexin I by TRPM7 channel-kinase. J. Biol. Chem. 279: 50643—50646. PMID 15485879 DOI:10.1074/jbc.C400441200

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з TRPM7 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Сполуки, які фізично взаємодіють з Transient receptor potential cation channel subfamily M member 7 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  3. Human PubMed Reference:.
  4. Mouse PubMed Reference:.
  5. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17994 (англ.) . Архів оригіналу за 23 травня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.
  6. UniProt, Q96QT4 (англ.) . Архів оригіналу за 19 серпня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 15
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

  • п
  • о
  • р
 
Ліганд-залежні
Потенціалкеровані
  • L-тип/Cavα
  • N-тип/Cavα2.2
  • P-тип/Cavα
  • Q-тип/Cavα2.1
  • R-тип/Cavα2.3
  • T-тип/Cavα
 
постійно відчинені
Протончутливі
  • Кислота
Потенціалкеровані
 
K+: Калієві канали
Кальцій-активовані
Вхідного випрямлення
Двопородоменні
Потенціалкеровані
 
Різні
Cl: Хлорні канали
H+: Протонні канали
M+: CNG-канали
M+: TRP-канали
H2O (+ розчини): Порини
Цитоплазма: Щілинні контакти
 
За механізмом залежності
Ion channel class