CLCC1

Ідентифікатори

Символи

CLCC1, MCLC, chloride channel CLIC like 1

Зовнішні ІД

OMIM: 617539 MGI: 2385186 HomoloGene: 9032 GeneCards: CLCC1

Реагує на сполуку

Viroporin 3a^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• chloride channel activity
Клітинна компонента	• integral component of membrane • комплекс Ґольджі • ендоплазматичний ретикулум • мембрана • клітинне ядро • chloride channel complex • внутрішньоклітинна мембранна органела
Біологічний процес	• chloride transport • chloride transmembrane transport • ion transport • GO:0015915 транспорт
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


23155


229725

Ensembl


ENSG00000121940


ENSMUSG00000027884

UniProt


Q96S66


Q99LI2

RefSeq (мРНК)


NM_015127 NM_001048210 NM_001278202 NM_001278203


NM_001177770 NM_001177771 NM_145543 NM_001355632

RefSeq (білок)

NP_001041675 NP_001265131 NP_001265132 NP_055942 NP_001364387
NP_001364388 NP_001364389 NP_001364390 NP_001364391 NP_001364392 NP_001364393 NP_001364394 NP_001364395 NP_001364396 NP_001364397 NP_001364398 NP_001364399


NP_001171241 NP_001171242 NP_663518 NP_001342561

Локус (UCSC)

Хр. 1: 108.93 – 108.96 Mb

Хр. 3: 108.56 – 108.59 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CLCC1 (англ. Chloride channel CLIC like 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 551 амінокислот, а молекулярна маса — 62 023^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLCSLLLCEC	LLLVAGYAHD	DDWIDPTDML	NYDAASGTMR	KSQAKYGISG
EKDVSPDLSC	ADEISECYHK	LDSLTYKIDE	CEKKKREDYE	SQSNPVFRRY
LNKILIEAGK	LGLPDENKGD	MHYDAEIILK	RETLLEIQKF	LNGEDWKPGA
LDDALSDILI	NFKFHDFETW	KWRFEDSFGV	DPYNVLMVLL	CLLCIVVLVA
TELWTYVRWY	TQLRRVLIIS	FLFSLGWNWM	YLYKLAFAQH	QAEVAKMEPL
NNVCAKKMDW	TGSIWEWFRS	SWTYKDDPCQ	KYYELLLVNP	IWLVPPTKAL
AVTFTTFVTE	PLKHIGKGTG	EFIKALMKEI	PALLHLPVLI	IMALAILSFC
YGAGKSVHVL	RHIGGPESEP	PQALRPRDRR	RQEEIDYRPD	GGAGDADFHY
RGQMGPTEQG	PYAKTYEGRR	EILRERDVDL	RFQTGNKSPE	VLRAFDVPDA
EAREHPTVVP	SHKSPVLDTK	PKETGGILGE	GTPKESSTES	SQSAKPVSGQ
DTSGNTEGSP	AAEKAQLKSE	AAGSPDQGST	YSPARGVAGP	RGQDPVSSPC
G

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, хлорних каналів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з хлоридом. Локалізований у ядрі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, апараті гольджі.

Література

Nagasawa M., Kanzaki M., Iino Y., Morishita Y., Kojima I. (2001). Identification of a novel chloride channel expressed in the endoplasmic reticulum, Golgi apparatus, and nucleus. J. Biol. Chem. 276: 20413—20418. PMID 11279057 DOI:10.1074/jbc.M100366200
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Chloride channel CLIC like 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29675 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q96S66 (англ.) . Архів оригіналу за 9 листопада 2016. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Іонні канали

Ca²⁺: Кальцієві канали

Ліганд-залежні	Інозитолтрифосфатні 1 2 3 ріанодинові 1 2 3

Потенціалкеровані	L-тип/Ca_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 N-тип/Ca_vα2.2 P-тип/Ca_vα 1 Q-тип/Ca_vα2.1 R-тип/Ca_vα2.3 1 T-тип/Ca_vα 3.1 3.2 3.3 α₂δ-субодиниці 1 2 β-компоненти β1 β2 β3 β4 γ-компоненти γ1 γ2 γ3 γ4 CATSPER 1 2 3 4 TPC 1 2

Na⁺: Натрієві канали

постійно відчинені	Епітеліальні α β γ δ

Протончутливі	Кислота 1 2 3 4

Потенціалкеровані	Na_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 1.9 7A Na_vβ 1 2 3 4

K⁺: Калієві канали

Кальцій-активовані	BK α1 β1 β2 β3 β4 SK SK1 SK2 SK3 IK channel IK1 K_Ca 1.1 2.1 2.2 2.3 3.1 4.1 4.2 5.1

Вхідного випрямлення	K_АТФ K_ir 1.1 2.1 2.2 2.3 2.4 2.6 GIRK/K_ir 3.1 3.2 3.3 3.4 K_ir 4.1 4.2 5.1 6.1 6.2 7.1

Двопородоменні	K2P 1 2 3 4 5 6 7 9 10 12 13 15 16 17 18

Потенціалкеровані	K_vα1-6 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 2.1 2.2 3.1 3.2 3.3 3.4 4.1 4.2 4.3 5.1 6.1 6.2 6.3 6.4 K_vα7-12 7.1 7.2 7.3 7.4 7.5 8.1 8.2 9.1 9.2 9.3 10.1 10.2 11.1 11.2 11.3 12.1 12.2 12.3 K_vβ 1 2 3 KCNIP 1 2 3 4 minK/ISK minK/ISK-подібний MiRP 1 2 3

Різні

Cl⁻: Хлорні канали	Кальцій-активовані Аноктамін ANO1 Бестрофін 1 2 CLCA 1 2 3 4 CFTR CLCN 1 2 3 4 5 6 7 KA KB CLIC 1 2 3 4 5 6 L1 CLNS 1A 1B

H⁺: Протонні канали	HVCN1

M⁺: CNG-канали	α 1 2 3 4 β 1 2 3 HCN FC 1 2 3 4

M⁺: TRP-канали	TRPA 1 TRPC 1 2 3 4 4AP 5 6 7 TRPM 1 2 3 4 5 6 7 8 TRPML 1 2 3 TRPN TRPP 1 2 TRPV 1 2 3 4 5 6

H₂O (+ розчини): Порини	Аквапорини 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 VDAC 1 2 3

Цитоплазма: Щілинні контакти	Коннексин A GJA1 GJA3 GJA4 GJA5 GJA8 GJA9 GJA10 B GJB1 GJB2 GJB3 GJB4 GJB5 GJB6 GJB7 C GJC1 GJC2 GJC3 D GJD2 GJD3 GJD4 Іннексин

За механізмом залежності

Ion channel class	Лігандкеровані Світлокеровані Потенціалкеровані Механічно-активовані