HVCN1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3A2A

Ідентифікатори

Символи

HVCN1, HV1, VSOP, hydrogen voltage gated channel 1

Зовнішні ІД

OMIM: 611227 MGI: 1921346 HomoloGene: 12535 GeneCards: HVCN1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• ion channel activity • voltage-gated cation channel activity • voltage-gated ion channel activity • voltage-gated proton channel activity • identical protein binding
Клітинна компонента	• мембрана • integral component of membrane • клітинна мембрана • secretory granule membrane • specific granule membrane • integral component of plasma membrane • phagocytic vesicle membrane
Біологічний процес	• трансмембранний транспорт • regulation of ion transmembrane transport • cellular response to pH • response to zinc ion • ion transport • cellular response to zinc ion • sperm-egg recognition • response to pH • neutrophil degranulation • proton transmembrane transport • cell redox homeostasis
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


84329


74096

Ensembl


ENSG00000122986


ENSMUSG00000064267

UniProt


Q96D96


Q3U2S8

RefSeq (мРНК)


NM_001040107 NM_001256413 NM_032369


NM_001042489 NM_028752 NM_001359454

RefSeq (білок)


NP_001035196 NP_001243342 NP_115745


NP_001035954 NP_083028 NP_001346383

Локус (UCSC)

Хр. 12: 110.63 – 110.7 Mb

Хр. 5: 122.34 – 122.38 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

HVCN1 (англ. Hydrogen voltage gated channel 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 273 амінокислот, а молекулярна маса — 31 683^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MATWDEKAVT	RRAKVAPAER	MSKFLRHFTV	VGDDYHAWNI	NYKKWENEEE
EEEEEQPPPT	PVSGEEGRAA	APDVAPAPGP	APRAPLDFRG	MLRKLFSSHR
FQVIIICLVV	LDALLVLAEL	ILDLKIIQPD	KNNYAAMVFH	YMSITILVFF
MMEIIFKLFV	FRLEFFHHKF	EILDAVVVVV	SFILDIVLLF	QEHQFEALGL
LILLRLWRVA	RIINGIIISV	KTRSERQLLR	LKQMNVQLAA	KIQHLEFSCS
EKEQEIERLN	KLLRQHGLLG	EVN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, потенціалзалежних каналів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Ramsey I.S., Moran M.M., Chong J.A., Clapham D.E. (2006). A voltage-gated proton-selective channel lacking the pore domain. Nature. 440: 1213—1216. PMID 16554753 DOI:10.1038/nature04700

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:28240 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q96D96 (англ.) . Архів оригіналу за 8 грудня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 12

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Іонні канали

Ca²⁺: Кальцієві канали

Ліганд-залежні	Інозитолтрифосфатні 1 2 3 ріанодинові 1 2 3

Потенціалкеровані	L-тип/Ca_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 N-тип/Ca_vα2.2 P-тип/Ca_vα 1 Q-тип/Ca_vα2.1 R-тип/Ca_vα2.3 1 T-тип/Ca_vα 3.1 3.2 3.3 α₂δ-субодиниці 1 2 β-компоненти β1 β2 β3 β4 γ-компоненти γ1 γ2 γ3 γ4 CATSPER 1 2 3 4 TPC 1 2

Na⁺: Натрієві канали

постійно відчинені	Епітеліальні α β γ δ

Протончутливі	Кислота 1 2 3 4

Потенціалкеровані	Na_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 1.9 7A Na_vβ 1 2 3 4

K⁺: Калієві канали

Кальцій-активовані	BK α1 β1 β2 β3 β4 SK SK1 SK2 SK3 IK channel IK1 K_Ca 1.1 2.1 2.2 2.3 3.1 4.1 4.2 5.1

Вхідного випрямлення	K_АТФ K_ir 1.1 2.1 2.2 2.3 2.4 2.6 GIRK/K_ir 3.1 3.2 3.3 3.4 K_ir 4.1 4.2 5.1 6.1 6.2 7.1

Двопородоменні	K2P 1 2 3 4 5 6 7 9 10 12 13 15 16 17 18

Потенціалкеровані	K_vα1-6 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 2.1 2.2 3.1 3.2 3.3 3.4 4.1 4.2 4.3 5.1 6.1 6.2 6.3 6.4 K_vα7-12 7.1 7.2 7.3 7.4 7.5 8.1 8.2 9.1 9.2 9.3 10.1 10.2 11.1 11.2 11.3 12.1 12.2 12.3 K_vβ 1 2 3 KCNIP 1 2 3 4 minK/ISK minK/ISK-подібний MiRP 1 2 3

Різні

Cl⁻: Хлорні канали	Кальцій-активовані Аноктамін ANO1 Бестрофін 1 2 CLCA 1 2 3 4 CFTR CLCN 1 2 3 4 5 6 7 KA KB CLIC 1 2 3 4 5 6 L1 CLNS 1A 1B

H⁺: Протонні канали	HVCN1

M⁺: CNG-канали	α 1 2 3 4 β 1 2 3 HCN FC 1 2 3 4

M⁺: TRP-канали	TRPA 1 TRPC 1 2 3 4 4AP 5 6 7 TRPM 1 2 3 4 5 6 7 8 TRPML 1 2 3 TRPN TRPP 1 2 TRPV 1 2 3 4 5 6

H₂O (+ розчини): Порини	Аквапорини 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 VDAC 1 2 3

Цитоплазма: Щілинні контакти	Коннексин A GJA1 GJA3 GJA4 GJA5 GJA8 GJA9 GJA10 B GJB1 GJB2 GJB3 GJB4 GJB5 GJB6 GJB7 C GJC1 GJC2 GJC3 D GJD2 GJD3 GJD4 Іннексин

За механізмом залежності

Ion channel class	Лігандкеровані Світлокеровані Потенціалкеровані Механічно-активовані