KCNN2

KCNN2
Ідентифікатори
Символи KCNN2, KCa2.2, SK2, SKCA2, SKCa 2, hSK2, potassium calcium-activated channel subfamily N member 2, DYT34, NEDMAB
Зовнішні ІД OMIM: 605879 HomoloGene: 23150 GeneCards: KCNN2
Реагує на сполуку
tetraethylammonium, tubocurarine[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

protein homodimerization activity
protein domain specific binding
calcium-activated potassium channel activity
calmodulin binding
alpha-actinin binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
small conductance calcium-activated potassium channel activity

Клітинна компонента

integral component of membrane
мембрана
cell surface
neuronal cell body
клітинна мембрана
Z disc
dendritic spine
neuron projection

Біологічний процес

ion transport
potassium ion transport
regulation of potassium ion transmembrane transport
potassium ion transmembrane transport
membrane repolarization during atrial cardiac muscle cell action potential

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
3781
54262
Ensembl
ENSG00000080709
ENSRNOG00000016675
UniProt
Q9H2S1
P70604
RefSeq (мРНК)
NM_001278204
NM_021614
NM_170775
NM_001372233
NM_001309404
NM_019314
RefSeq (білок)
NP_001265133
NP_067627
NP_740721
NP_001359162
NP_001296333
NP_062187
Локус (UCSC) Хр. 5: 114.06 – 114.5 Mb н/д
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

KCNN2 (англ. Potassium calcium-activated channel subfamily N member 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 579 амінокислот, а молекулярна маса — 63 760[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MSSCRYNGGVMRPLSNLSASRRNLHEMDSEAQPLQPPASVGGGGGASSPS
AAAAAAAAVSSSAPEIVVSKPEHNNSNNLALYGTGGGGSTGGGGGGGGSG
HGSSSGTKSSKKKNQNIGYKLGHRRALFEKRKRLSDYALIFGMFGIVVMV
IETELSWGAYDKASLYSLALKCLISLSTIILLGLIIVYHAREIQLFMVDN
GADDWRIAMTYERIFFICLEILVCAIHPIPGNYTFTWTARLAFSYAPSTT
TADVDIILSIPMFLRLYLIARVMLLHSKLFTDASSRSIGALNKINFNTRF
VMKTLMTICPGTVLLVFSISLWIIAAWTVRACERYHDQQDVTSNFLGAMW
LISITFLSIGYGDMVPNTYCGKGVCLLTGIMGAGCTALVVAVVARKLELT
KAEKHVHNFMMDTQLTKRVKNAAANVLRETWLIYKNTKLVKKIDHAKVRK
HQRKFLQAIHQLRSVKMEQRKLNDQANTLVDLAKTQNIMYDMISDLNERS
EDFEKRIVTLETKLETLIGSIHALPGLISQTIRQQQRDFIEAQMESYDKH
VTYNAERSRSSSRRRRSSSTAPPTSSESS

Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою кальмодуліну. Локалізований у мембрані.

Література

  • Desai R., Peretz A., Idelson H., Lazarovici P., Attali B. (2000). Ca2+-activated K+ channels in human leukemic Jurkat T cells. Molecular cloning, biochemical and functional characterization. J. Biol. Chem. 275: 39954—39963. PMID 10991935 DOI:10.1074/jbc.M001562200
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

  1. Сполуки, які фізично взаємодіють з Potassium calcium-activated channel subfamily N member 2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6291 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2016. Процитовано 31 серпня 2017.
  5. UniProt, Q9H2S1 (англ.) . Архів оригіналу за 28 жовтня 2016. Процитовано 31 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 5
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

  • п
  • о
  • р
 
Ліганд-залежні
Потенціалкеровані
  • L-тип/Cavα
  • N-тип/Cavα2.2
  • P-тип/Cavα
  • Q-тип/Cavα2.1
  • R-тип/Cavα2.3
  • T-тип/Cavα
 
постійно відчинені
Протончутливі
  • Кислота
Потенціалкеровані
 
K+: Калієві канали
Кальцій-активовані
Вхідного випрямлення
Двопородоменні
Потенціалкеровані
 
Різні
Cl: Хлорні канали
H+: Протонні канали
M+: CNG-канали
M+: TRP-канали
H2O (+ розчини): Порини
Цитоплазма: Щілинні контакти
 
За механізмом залежності
Ion channel class