RYR3

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4ERV

Ідентифікатори

Символи

RYR3, RYR-3, ryanodine receptor 3

Зовнішні ІД

OMIM: 180903 MGI: 99684 HomoloGene: 68151 GeneCards: RYR3

Пов'язані генетичні захворювання

атеросклероз, ВІЛ-заворювання^[1]

Реагує на сполуку

Аденозинтрифосфат, кофеїн, дантролен^[2]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• ryanodine-sensitive calcium-release channel activity • calcium channel activity • calcium-release channel activity • calmodulin binding • ion channel activity • calcium-induced calcium release activity • calcium ion binding
Клітинна компонента	• organelle membrane • integral component of membrane • мембрана • внутрішньоклітинна мембранна органела • sarcoplasmic reticulum • sarcoplasmic reticulum membrane • ендоплазматичний ретикулум • perinuclear region of cytoplasm • клітинна мембрана • smooth endoplasmic reticulum • Z disc • cytoplasmic vesicle membrane • Кальцієві канали • Сарколема
Біологічний процес	• cellular response to calcium ion • cellular response to magnesium ion • regulation of cardiac conduction • cellular calcium ion homeostasis • ion transport • ion transmembrane transport • calcium ion transmembrane transport • cellular response to caffeine • cellular response to ATP • protein homotetramerization • calcium ion transport • negative regulation of cytosolic calcium ion concentration • трансмембранний транспорт • release of sequestered calcium ion into cytosol
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6263


20192

Ensembl


ENSG00000198838


ENSMUSG00000057378

UniProt


Q15413


A2AGL3

RefSeq (мРНК)


NM_001036 NM_001243996


NM_177652 NM_001319156

RefSeq (білок)


NP_001027 NP_001230925


NP_001306085

Локус (UCSC)

Хр. 15: 33.31 – 33.87 Mb

Хр. 2: 112.46 – 113.05 Mb

PubMed search

^[3]

^[4]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

RYR3 (англ. Ryanodine receptor 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 4 870 амінокислот, а молекулярна маса — 552 042^[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAEGGEGGED	EIQFLRTEDE	VVLQCIATIH	KEQRKFCLAA	EGLGNRLCFL
EPTSEAKYIP	PDLCVCNFVL	EQSLSVRALQ	EMLANTGENG	GEGAAQGGGH
RTLLYGHAVL	LRHSFSGMYL	TCLTTSRSQT	DKLAFDVGLR	EHATGEACWW
TIHPASKQRS	EGEKVRIGDD	LILVSVSSER	YLHLSVSNGN	IQVDASFMQT
LWNVHPTCSG	SSIEEGYLLG	GHVVRLFHGH	DECLTIPSTD	QNDSQHRRIF
YEAGGAGTRA	RSLWRVEPLR	ISWSGSNIRW	GQAFRLRHLT	TGHYLALTED
QGLILQDRAK	SDTKSTAFSF	RASKELKEKL	DSSHKRDIEG	MGVPEIKYGD
SVCFVQHIAS	GLWVTYKAQD	AKTSRLGPLK	RKVILHQEGH	MDDGLTLQRC
QREESQAARI	IRNTTALFSQ	FVSGNNRTAA	PITLPIEEVL	QTLQDLIAYF
QPPEEEMRHE	DKQNKLRSLK	NRQNLFKEEG	MLALVLNCID	RLNVYNSVAH
FAGIAREESG	MAWKEILNLL	YKLLAALIRG	NRNNCAQFSN	NLDWLISKLD
RLESSSGILE	VLHCILTESP	EALNLIAEGH	IKSIISLLDK	HGRNHKVLDI
LCSLCLCNGV	AVRANQNLIC	DNLLPRRNLL	LQTRLINDVT	SIRPNIFLGV
AEGSAQYKKW	YFELIIDQVD	PFLTAEPTHL	RVGWASSSGY	APYPGGGEGW
GGNGVGDDLY	SYGFDGLHLW	SGRIPRAVAS	INQHLLRSDD	VVSCCLDLGV
PSISFRINGQ	PVQGMFENFN	TDGLFFPVMS	FSAGVKVRFL	MGGRHGEFKF
LPPSGYAPCY	EALLPKEKMR	LEPVKEYKRD	ADGIRDLLGT	TQFLSQASFI
PCPVDTSQVI	LPPHLEKIRD	RLAENIHELW	GMNKIELGWT	FGKIRDDNKR
QHPCLVEFSK	LPETEKNYNL	QMSTETLKTL	LALGCHIAHV	NPAAEEDLKK
VKLPKNYMMS	NGYKPAPLDL	SDVKLLPPQE	ILVDKLAENA	HNVWAKDRIK
QGWTYGIQQD	LKNKRNPRLV	PYALLDERTK	KSNRDSLREA	VRTFVGYGYN
IEPSDQELAD	SAVEKVSIDK	IRFFRVERSY	AVRSGKWYFE	FEVVTGGDMR
VGWARPGCRP	DVELGADDQA	FVFEGNRGQR	WHQGSGYFGR	TWQPGDVVGC
MINLDDASMI	FTLNGELLIT	NKGSELAFAD	YEIENGFVPI	CCLGLSQIGR
MNLGTDASTF	KFYTMCGLQE	GFEPFAVNMN	RDVAMWFSKR	LPTFVNVPKD
HPHIEVMRID	GTMDSPPCLK	VTHKTFGTQN	SNADMIYCRL	SMPVECHSSF
SHSPCLDSEA	FQKRKQMQEI	LSHTTTQCYY	AIRIFAGQDP	SCVWVGWVTP
DYHLYSEKFD	LNKNCTVTVT	LGDERGRVHE	SVKRSNCYMV	WGGDIVASSQ
RSNRSNVDLE	IGCLVDLAMG	MLSFSANGKE	LGTCYQVEPN	TKVFPAVFLQ
PTSTSLFQFE	LGKLKNAMPL	SAAIFRSEEK	NPVPQCPPRL	DVQTIQPVLW
SRMPNSFLKV	ETERVSERHG	WVVQCLEPLQ	MMALHIPEEN	RCVDILELCE
QEDLMRFHYH	TLRLYSAVCA	LGNSRVAYAL	CSHVDLSQLF	YAIDNKYLPG
LLRSGFYDLL	ISIHLASAKE	RKLMMKNEYI	IPITSTTRNI	RLFPDESKRH
GLPGVGLRTC	LKPGFRFSTP	CFVVTGEDHQ	KQSPEIPLES	LRTKALSMLT
EAVQCSGAHI	RDPVGGSVEF	QFVPVLKLIG	TLLVMGVFDD	DDVRQILLLI
DPSVFGEHSA	GTEEGAEKEE	VTQVEEKAVE	AGEKAGKEAP	VKGLLQTRLP
ESVKLQMCEL	LSYLCDCELQ	HRVEAIVAFG	DIYVSKLQAN	QKFRYNELMQ
ALNMSAALTA	RKTKEFRSPP	QEQINMLLNF	QLGENCPCPE	EIREELYDFH
EDLLLHCGVP	LEEEEEEEED	TSWTGKLCAL	VYKIKGPPKP	EKEQPTEEEE
RCPTTLKELI	SQTMICWAQE	DQIQDSELVR	MMFNLLRRQY	DSIGELLQAL
RKTYTISHTS	VSDTINLLAA	LGQIRSLLSV	RMGKEEELLM	INGLGDIMNN
KVFYQHPNLM	RVLGMHETVM	EVMVNVLGTE	KSQIAFPKMV	ASCCRFLCYF
CRISRQNQKA	MFEHLSYLLE	NSSVGLASPS	MRGSTPLDVA	ASSVMDNNEL
ALSLEEPDLE	KVVTYLAGCG	LQSCPMLLAK	GYPDVGWNPI	EGERYLSFLR
FAVFVNSESV	EENASVVVKL	LIRRPECFGP	ALRGEGGNGL	LAAMQGAIKI
SENPALDLPS	QGYKREVSTG	DDEEEEEIVH	MGNAIMSFYS	ALIDLLGRCA
PEMHLIQTGK	GEAIRIRSIL	RSLVPTEDLV	GIISIPLKLP	SLNKDGSVSE
PDMAANFCPD	HKAPMVLFLD	RVYGIKDQTF	LLHLLEVGFL	PDLRASASLD
TVSLSTTEAA	LALNRYICSA	VLPLLTRCAP	LFAGTEHCTS	LIDSTLQTIY
RLSKGRSLTK	AQRDTIEECL	LAICNHLRPS	MLQQLLRRLV	FDVPQLNEYC
KMPLKLLTNH	YEQCWKYYCL	PSGWGSYGLA	VEEELHLTEK	LFWGIFDSLS
HKKYDPDLFR	MALPCLSAIA	GALPPDYLDT	RITATLEKQI	SVDADGNFDP
KPINTMNFSL	PEKLEYIVTK	YAEHSHDKWA	CDKSQSGWKY	GISLDENVKT
HPLIRPFKTL	TEKEKEIYRW	PARESLKTML	AVGWTVERTK	EGEALVQQRE
NEKLRSVSQA	NQGNSYSPAP	LDLSNVVLSR	ELQGMVEVVA	ENYHNIWAKK
KKLELESKGG	GSHPLLVPYD	TLTAKEKFKD	REKAQDLFKF	LQVNGIIVSR
GMKDMELDAS	SMEKRFAYKF	LKKILKYVDS	AQEFIAHLEA	IVSSGKTEKS
PRDQEIKFFA	KVLLPLVDQY	FTSHCLYFLS	SPLKPLSSSG	YASHKEKEMV
AGLFCKLAAL	VRHRISLFGS	DSTTMVSCLH	ILAQTLDTRT	VMKSGSELVK
AGLRAFFENA	AEDLEKTSEN	LKLGKFTHSR	TQIKGVSQNI	NYTTVALLPI
LTSIFEHVTQ	HQFGMDLLLG	DVQISCYHIL	CSLYSLGTGK	NIYVERQRPA
LGECLASLAA	AIPVAFLEPT	LNRYNPLSVF	NTKTPRERSI	LGMPDTVEDM
CPDIPQLEGL	MKEINDLAES	GARYTEMPHV	IEVILPMLCN	YLSYWWERGP
ENLPPSTGPC	CTKVTSEHLS	LILGNILKII	NNNLGIDEAS	WMKRIAVYAQ
PIISKARPDL	LRSHFIPTLE	KLKKKAVKTV	QEEEQLKADG	KGDTQEAELL
ILDEFAVLCR	DLYAFYPMLI	RYVDNNRSNW	LKSPDADSDQ	LFRMVAEVFI
LWCKSHNFKR	EEQNFVIQNE	INNLAFLTGD	SKSKMSKAMQ	VKSGGQDQER
KKTKRRGDLY	SIQTSLIVAA	LKKMLPIGLN	MCTPGDQELI	SLAKSRYSHR
DTDEEVREHL	RNNLHLQEKS	DDPAVKWQLN	LYKDVLKSEE	PFNPEKTVER
VQRISAAVFH	LEQVEQPLRS	KKAVWHKLLS	KQRKRAVVAC	FRMAPLYNLP
RHRSINLFLH	GYQRFWIETE	EYSFEEKLVQ	DLAKSPKVEE	EEEEETEKQP
DPLHQIILYF	SRNALTERSK	LEDDPLYTSY	SSMMAKSCQS	GEDEEEDEDK
EKTFEEKEME	KQKTLYQQAR	LHERGAAEMV	LQMISASKGE	MSPMVVETLK
LGIAILNGGN	AGVQQKMLDY	LKEKKDAGFF	QSLSGLMQSC	SVLDLNAFER
QNKAEGLGMV	TEEGTLIVRE	RGEKVLQNDE	FTRDLFRFLQ	LLCEGHNSDF
QNFLRTQMGN	TTTVNVIIST	VDYLLRLQES	ISDFYWYYSG	KDIIDESGQH
NFSKALAVTK	QIFNSLTEYI	QGPCIGNQQS	LAHSRLWDAV	VGFLHVFANM
QMKLSQDSSQ	IELLKELLDL	LQDMVVMLLS	LLEGNVVNGT	IGKQMVDTLV
ESSTNVEMIL	KFFDMFLKLK	DLTSSDTFKE	YDPDGKGIIS	KKEFQKAMEG
QKQYTQSEID	FLLSCAEADE	NDMFNYVDFV	DRFHEPAKDI	GFNVAVLLTN
LSEHMPNDSR	LKCLLDPAES	VLNYFEPYLG	RIEIMGGAKK	IERVYFEISE
SSRTQWEKPQ	VKESKRQFIF	DVVNEGGEQE	KMELFVNFCE	DTIFEMQLAS
QISESDSADR	PEEEEEDEDS	SYVLEIAGEE	EEDGSLEPAS	AFAMACASVK
RNVTDFLKRA	TLKNLRKQYR	NVKKMTAKEL	VKVLFSFFWM	LFVGLFQLLF
TILGGIFQIL	WSTVFGGGLV	EGAKNIRVTK	ILGDMPDPTQ	FGIHDDTMEA
ERAEVMEPGI	TTELVHFIKG	EKGDTDIMSD	LFGLHPKKEG	SLKHGPEVGL
GDLSEIIGKD	EPPTLESTVQ	KKRKAQAAEM	KAANEAEGKV	ESEKADMEDG
EKEDKDKEEE	QAEYLWTEVT	KKKKRRCGQK	VEKPEAFTAN	FFKGLEIYQT
KLLHYLARNF	YNLRFLALFV	AFAINFILLF	YKVTEEPLEE	ETEDVANLWN
SFNDEEEEEA	MVFFVLQEST	GYMAPTLRAL	AIIHTIISLV	CVVGYYCLKV
PLVVFKREKE	IARKLEFDGL	YITEQPSEDD	IKGQWDRLVI	NTPSFPNNYW
DKFVKRKVIN	KYGDLYGAER	IAELLGLDKN	ALDFSPVEET	KAEAASLVSW
LSSIDMKYHI	WKLGVVFTDN	SFLYLAWYTT	MSVLGHYNNF	FFAAHLLDIA
MGFKTLRTIL	SSVTHNGKQL	VLTVGLLAVV	VYLYTVVAFN	FFRKFYNKSE
DDDEPDMKCD	DMMTCYLFHM	YVGVRAGGGI	GDEIEDPAGD	PYEMYRIVFD
ITFFFFVIVI	LLAIIQGLII	DAFGELRDQQ	EQVREDMETK	CFICGIGNDY
FDTTPHGFET	HTLQEHNLAN	YLFFLMYLIN	KDETEHTGQE	SYVWKMYQER
CWDFFPAGDC	FRKQYEDQLG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, іонних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, транспорт кальцію, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою кальмодуліну, іоном кальцію. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, саркоплазматичному ретикулумі, мікросомах.

Література

Leeb T., Brenig B. (1998). cDNA cloning and sequencing of the human ryanodine receptor type 3 (RYR3) reveals a novel alternative splice site in the RYR3 gene. FEBS Lett. 423: 367—370. PMID 9515741 DOI:10.1016/S0014-5793(98)00124-0
Martin C., Chapman K.E., Seckl J.R., Ashley R.H. (1998). Partial cloning and differential expression of ryanodine receptor/calcium-release channel genes in human tissues including the hippocampus and cerebellum. Neuroscience. 85: 205—216. PMID 9607712 DOI:10.1016/S0306-4522(97)00612-X
Sorrentino V., Giannini G., Malzac P., Mattei M.-G. (1993). Localization of a novel ryanodine receptor gene (RYR3) to human chromosome 15q14-q15 by in situ hybridization. Genomics. 18: 163—165. PMID 8276408 DOI:10.1006/geno.1993.1446
Lynn S., Morgan J.M., Lamb H.K., Meissner G., Gillespie J.I. (1995). Isolation and partial cloning of ryanodine-sensitive Ca2+ release channel protein isoforms from human myometrial smooth muscle. FEBS Lett. 372: 6—12. PMID 7556644 DOI:10.1016/0014-5793(95)00924-X
Schwarzmann N., Kunerth S., Weber K., Mayr G.W., Guse A.H. (2002). Knock-down of the type 3 ryanodine receptor impairs sustained Ca2+ signaling via the T cell receptor/CD3 complex. J. Biol. Chem. 277: 50636—50642. PMID 12354756 DOI:10.1074/jbc.M209061200
Yuchi Z., Lau K., Van Petegem F. (2012). Disease mutations in the ryanodine receptor central region: crystal structures of a phosphorylation hot spot domain. Structure. 20: 1201—1211. PMID 22705209 DOI:10.1016/j.str.2012.04.015

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з RYR3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Ryanodine receptor 3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10485 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q15413 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 15

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Іонні канали

Ca²⁺: Кальцієві канали

Ліганд-залежні	Інозитолтрифосфатні 1 2 3 ріанодинові 1 2 3

Потенціалкеровані	L-тип/Ca_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 N-тип/Ca_vα2.2 P-тип/Ca_vα 1 Q-тип/Ca_vα2.1 R-тип/Ca_vα2.3 1 T-тип/Ca_vα 3.1 3.2 3.3 α₂δ-субодиниці 1 2 β-компоненти β1 β2 β3 β4 γ-компоненти γ1 γ2 γ3 γ4 CATSPER 1 2 3 4 TPC 1 2

Na⁺: Натрієві канали

постійно відчинені	Епітеліальні α β γ δ

Протончутливі	Кислота 1 2 3 4

Потенціалкеровані	Na_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 1.9 7A Na_vβ 1 2 3 4

K⁺: Калієві канали

Кальцій-активовані	BK α1 β1 β2 β3 β4 SK SK1 SK2 SK3 IK channel IK1 K_Ca 1.1 2.1 2.2 2.3 3.1 4.1 4.2 5.1

Вхідного випрямлення	K_АТФ K_ir 1.1 2.1 2.2 2.3 2.4 2.6 GIRK/K_ir 3.1 3.2 3.3 3.4 K_ir 4.1 4.2 5.1 6.1 6.2 7.1

Двопородоменні	K2P 1 2 3 4 5 6 7 9 10 12 13 15 16 17 18

Потенціалкеровані	K_vα1-6 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 2.1 2.2 3.1 3.2 3.3 3.4 4.1 4.2 4.3 5.1 6.1 6.2 6.3 6.4 K_vα7-12 7.1 7.2 7.3 7.4 7.5 8.1 8.2 9.1 9.2 9.3 10.1 10.2 11.1 11.2 11.3 12.1 12.2 12.3 K_vβ 1 2 3 KCNIP 1 2 3 4 minK/ISK minK/ISK-подібний MiRP 1 2 3

Різні

Cl⁻: Хлорні канали	Кальцій-активовані Аноктамін ANO1 Бестрофін 1 2 CLCA 1 2 3 4 CFTR CLCN 1 2 3 4 5 6 7 KA KB CLIC 1 2 3 4 5 6 L1 CLNS 1A 1B

H⁺: Протонні канали	HVCN1

M⁺: CNG-канали	α 1 2 3 4 β 1 2 3 HCN FC 1 2 3 4

M⁺: TRP-канали	TRPA 1 TRPC 1 2 3 4 4AP 5 6 7 TRPM 1 2 3 4 5 6 7 8 TRPML 1 2 3 TRPN TRPP 1 2 TRPV 1 2 3 4 5 6

H₂O (+ розчини): Порини	Аквапорини 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 VDAC 1 2 3

Цитоплазма: Щілинні контакти	Коннексин A GJA1 GJA3 GJA4 GJA5 GJA8 GJA9 GJA10 B GJB1 GJB2 GJB3 GJB4 GJB5 GJB6 GJB7 C GJC1 GJC2 GJC3 D GJD2 GJD3 GJD4 Іннексин

За механізмом залежності

Ion channel class	Лігандкеровані Світлокеровані Потенціалкеровані Механічно-активовані