CLIC3

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3FY7, 3KJY

Ідентифікатори

Символи

CLIC3, chloride intracellular channel 3

Зовнішні ІД

OMIM: 606533 MGI: 1916704 HomoloGene: 3432 GeneCards: CLIC3

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • voltage-gated ion channel activity • chloride channel activity • glutathione transferase activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • integral component of membrane • екзосома • мембрана • клітинне ядро • chloride channel complex • ядерні тільця
Біологічний процес	• regulation of ion transmembrane transport • chloride transport • ion transport • GO:0072468 сигнальна трансдукція • chloride transmembrane transport • glutathione metabolic process • GO:0015915 транспорт • ion transmembrane transport
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


9022


69454

Ensembl


ENSG00000169583


ENSMUSG00000015093

UniProt


O95833


Q9D7P7

RefSeq (мРНК)


NM_004669


NM_027085

RefSeq (білок)


NP_004660


NP_081361

Локус (UCSC)

Хр. 9: 136.99 – 137 Mb

Хр. 2: 25.35 – 25.35 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CLIC3 (англ. Chloride intracellular channel 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 236 амінокислот, а молекулярна маса — 26 648^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAETKLQLFV	KASEDGESVG	HCPSCQRLFM	VLLLKGVPFT	LTTVDTRRSP
DVLKDFAPGS	QLPILLYDSD	AKTDTLQIED	FLEETLGPPD	FPSLAPRYRE
SNTAGNDVFH	KFSAFIKNPV	PAQDEALYQQ	LLRALARLDS	YLRAPLEHEL
AGEPQLRESR	RRFLDGDRLT	LADCSLLPKL	HIVDTVCAHF	RQAPIPAELR
GVRRYLDSAM	QEKEFKYTCP	HSAEILAAYR	PAVHPR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, потенціалзалежних каналів, хлорних каналів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт. Білок має сайт для зв'язування з хлоридом. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Qian Z., Okuhara D., Abe M.K., Rosner M.R. (1999). Molecular cloning and characterization of a mitogen-activated protein kinase-associated intracellular chloride channel. J. Biol. Chem. 274: 1621—1627. PMID 9880541 DOI:10.1074/jbc.274.3.1621
Littler D.R., Brown L.J., Breit S.N., Perrakis A., Curmi P.M. (2010). Structure of human CLIC3 at 2 A resolution. Proteins. 78: 1594—1600. PMID 20146363 DOI:10.1002/prot.22675

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2064 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, O95833 (англ.) . Архів оригіналу за 16 вересня 2016. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 9

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Іонні канали

Ca²⁺: Кальцієві канали

Ліганд-залежні	Інозитолтрифосфатні 1 2 3 ріанодинові 1 2 3

Потенціалкеровані	L-тип/Ca_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 N-тип/Ca_vα2.2 P-тип/Ca_vα 1 Q-тип/Ca_vα2.1 R-тип/Ca_vα2.3 1 T-тип/Ca_vα 3.1 3.2 3.3 α₂δ-субодиниці 1 2 β-компоненти β1 β2 β3 β4 γ-компоненти γ1 γ2 γ3 γ4 CATSPER 1 2 3 4 TPC 1 2

Na⁺: Натрієві канали

постійно відчинені	Епітеліальні α β γ δ

Протончутливі	Кислота 1 2 3 4

Потенціалкеровані	Na_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 1.9 7A Na_vβ 1 2 3 4

K⁺: Калієві канали

Кальцій-активовані	BK α1 β1 β2 β3 β4 SK SK1 SK2 SK3 IK channel IK1 K_Ca 1.1 2.1 2.2 2.3 3.1 4.1 4.2 5.1

Вхідного випрямлення	K_АТФ K_ir 1.1 2.1 2.2 2.3 2.4 2.6 GIRK/K_ir 3.1 3.2 3.3 3.4 K_ir 4.1 4.2 5.1 6.1 6.2 7.1

Двопородоменні	K2P 1 2 3 4 5 6 7 9 10 12 13 15 16 17 18

Потенціалкеровані	K_vα1-6 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 2.1 2.2 3.1 3.2 3.3 3.4 4.1 4.2 4.3 5.1 6.1 6.2 6.3 6.4 K_vα7-12 7.1 7.2 7.3 7.4 7.5 8.1 8.2 9.1 9.2 9.3 10.1 10.2 11.1 11.2 11.3 12.1 12.2 12.3 K_vβ 1 2 3 KCNIP 1 2 3 4 minK/ISK minK/ISK-подібний MiRP 1 2 3

Різні

Cl⁻: Хлорні канали	Кальцій-активовані Аноктамін ANO1 Бестрофін 1 2 CLCA 1 2 3 4 CFTR CLCN 1 2 3 4 5 6 7 KA KB CLIC 1 2 3 4 5 6 L1 CLNS 1A 1B

H⁺: Протонні канали	HVCN1

M⁺: CNG-канали	α 1 2 3 4 β 1 2 3 HCN FC 1 2 3 4

M⁺: TRP-канали	TRPA 1 TRPC 1 2 3 4 4AP 5 6 7 TRPM 1 2 3 4 5 6 7 8 TRPML 1 2 3 TRPN TRPP 1 2 TRPV 1 2 3 4 5 6

H₂O (+ розчини): Порини	Аквапорини 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 VDAC 1 2 3

Цитоплазма: Щілинні контакти	Коннексин A GJA1 GJA3 GJA4 GJA5 GJA8 GJA9 GJA10 B GJB1 GJB2 GJB3 GJB4 GJB5 GJB6 GJB7 C GJC1 GJC2 GJC3 D GJD2 GJD3 GJD4 Іннексин

За механізмом залежності

Ion channel class	Лігандкеровані Світлокеровані Потенціалкеровані Механічно-активовані