VPREB1

VPREB1
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

2H32, 2H3N, 3BJ9

Идентификаторы
ПсевдонимыVPREB1, IGI, IGVPB, VPREB, CD179a, pre-B lymphocyte 1, V-set pre-B cell surrogate light chain 1
Внешние IDOMIM: 605141 MGI: 98936 HomoloGene: 84741 GeneCards: VPREB1
Расположение гена (человек)
22-я хромосома человека
Хр.22-я хромосома человека[1]
22-я хромосома человека
Расположение в геноме VPREB1
Расположение в геноме VPREB1
Локус22q11.22Начало22,244,780 bp[1]
Конец22,245,515 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
16-я хромосома мыши
Хр.16-я хромосома мыши[2]
16-я хромосома мыши
Расположение в геноме VPREB1
Расположение в геноме VPREB1
Локус16 A3|16 10.46 cMНачало16,686,267 bp[2]
Конец16,688,707 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
    н/д
Наибольшая экспрессия в
  • foregut
BioGPS
Дополнительные справочные данные
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

7441

22362

Ensembl

ENSG00000169575

ENSMUSG00000059305

UniProt

P12018

P13372

RefSeq (мРНК)

NM_007128
NM_001303509

NM_016982

RefSeq (белок)

NP_001290438
NP_009059

NP_058678

Локус (UCSC)Chr 22: 22.24 – 22.25 MbChr 16: 16.69 – 16.69 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

Йота-цепь иммуноглобулина (англ. Immunoglobulin iota chain; CD179a) — мембранный белок суперсемейства иммуноглобулинов. Продукт гена человека VPREB1[5][6].

Функции

VpreB/CD179a — йота (ι)-цепь иммуноглобулина, полипептид, состоящий из 126 аминокислот, молекулярная масса 16-18 кДа. Экспрессирован на ранних стадиях развития B-лимфоцитов, а именно на проB-клетках и ранних преВ-клетках. Белок имеет структуру, сходную с иммуноглобулиновым доменом V типа, но не содержит последний бета-лист (бета-лист 7) типичного Ig V домена. Вместо этого C-конец белка не похож ни на один другой. VpreB/CD179a нековалентно ассоциирован с IGLL1/CD179b, образуя структуру, подобную лёгкой цепи иммуноглобулинов, которую называют суррогатной лёгкой цепью либо псевдолёгкой цепью. В этом комплексе неполный Ig V домен VpreB/CD179a дополняется экстра-бета-листом 7 молекулы IGLL1/CD179b. На поверхности ранних преВ-клеток гетеродимер CD179a/CD179b связан дисульфидной связью с мембранной тяжёлой мю-цепью в ассоциации со вспомогательным белковым гетеродимером Igα/Igβ (CD79a/CD79b). В результате этот комплекс формирует пре-B-клеточный рецептор. Хотя патологии, ассоциированные с CD179a ещё не описаны, недостаточность других компонентов рецептора, включая CD179b, Ig тяжёлую мю-цепь и CD79a, приводит к тяжёлому нарушению развития B-клеток и агаммаглобулинемии у человека. Пре-B-клеточный рецептор передаёт сигнал для (1) клеточной пролиферации, дифференциации проB- в преB-клетки; (2) аллельного исключения в генном локусе Ig тяжёлых цепей и (3) стимуляции V(D)J-рекомбинации Ig лёгких цепей. Таким образом, пре-B-клеточный рецептор функционирует как чек-пойнт ранних этапов развития B-клеток для контроля продукции Ig тяжёлых мю-цепей за счёт функциональной рекомбинации генов тяжёлых цепей, а также способности тяжёлых цепей связываться с лёгкими цепями[6].

Примечания

  1. 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000169575 - Ensembl, May 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000059305 - Ensembl, May 2017
  3. Ссылка на публикацию человека на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. Ссылка на публикацию мыши на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. Bauer SR, Huebner K, Budarf M, Finan J, Erikson J, Emanuel BS, Nowell PC, Croce CM, Melchers F (Nov 1988). "The human Vpre B gene is located on chromosome 22 near a cluster of V lambda gene segments". Immunogenetics. 28 (5): 328—33. doi:10.1007/BF00364231. PMID 3139558. S2CID 6981867.
  6. 1 2 Entrez Gene: VPREB1 pre-B lymphocyte gene 1  (неопр.).

Литература

  • Tsubata T, Reth M (September 1990). "The products of pre-B cell-specific genes (lambda 5 and VpreB) and the immunoglobulin mu chain form a complex that is transported onto the cell surface". The Journal of Experimental Medicine. 172 (3): 973—6. doi:10.1084/jem.172.3.973. PMC 2188549. PMID 2117639.
  • Bauer SR, Kudo A, Melchers F (January 1988). "Structure and pre-B lymphocyte restricted expression of the VpreB in humans and conservation of its structure in other mammalian species". The EMBO Journal. 7 (1): 111—6. doi:10.1002/j.1460-2075.1988.tb02789.x. PMC 454222. PMID 3258819.
  • Guelpa-Fonlupt V, Bossy D, Alzari P, Fumoux F, Fougereau M, Schiff C (October 1994). "The human pre-B cell receptor: structural constraints for a tentative model of the pseudo-light (psi L) chain". Molecular Immunology. 31 (14): 1099—108. doi:10.1016/0161-5890(94)90105-8. PMID 7935499.
  • Ohnishi K, Takemori T (November 1994). "Molecular components and assembly of mu.surrogate light chain complexes in pre-B cell lines". The Journal of Biological Chemistry. 269 (45): 28347—53. PMID 7961773.
  • Guelpa-Fonlupt V, Tonnelle C, Blaise D, Fougereau M, Fumoux F (January 1994). "Discrete early pro-B and pre-B stages in normal human bone marrow as defined by surface pseudo-light chain expression". European Journal of Immunology. 24 (1): 257—64. doi:10.1002/eji.1830240140. PMID 8020565. S2CID 20176205.
  • Bornemann KD, Brewer JW, Perez E, Doerre S, Sita R, Corley RB (March 1997). "Secretion of soluble pre-B cell receptors by pre-B cells". Journal of Immunology. 158 (6): 2551—7. PMID 9058786.
  • Kawasaki K, Minoshima S, Nakato E, Shibuya K, Shintani A, Schmeits JL, Wang J, Shimizu N (March 1997). "One-megabase sequence analysis of the human immunoglobulin lambda gene locus". Genome Research. 7 (3): 250—61. doi:10.1101/gr.7.3.250. PMID 9074928.
  • Fang T, Smith BP, Roman CA (October 2001). "Conventional and surrogate light chains differentially regulate Ig mu and Dmu heavy chain maturation and surface expression". Journal of Immunology. 167 (7): 3846—57. doi:10.4049/jimmunol.167.7.3846. PMID 11564802.
  • Gisler R, Sigvardsson M (May 2002). "The human V-preB promoter is a target for coordinated activation by early B cell factor and E47". Journal of Immunology. 168 (10): 5130—8. doi:10.4049/jimmunol.168.10.5130. PMID 11994467.
  • Gauthier L, Rossi B, Roux F, Termine E, Schiff C (October 2002). "Galectin-1 is a stromal cell ligand of the pre-B cell receptor (BCR) implicated in synapse formation between pre-B and stromal cells and in pre-BCR triggering". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 99 (20): 13014—9. Bibcode:2002PNAS...9913014G. doi:10.1073/pnas.202323999. PMC 130578. PMID 12271131.
  • Collins JE, Wright CL, Edwards CA, Davis MP, Grinham JA, Cole CG, Goward ME, Aguado B, Mallya M, Mokrab Y, Huckle EJ, Beare DM, Dunham I (2005). "A genome annotation-driven approach to cloning the human ORFeome". Genome Biology. 5 (10): R84. doi:10.1186/gb-2004-5-10-r84. PMC 545604. PMID 15461802.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (не помеченный открытым DOI) (ссылка)
  • Rossi B, Espeli M, Schiff C, Gauthier L (July 2006). "Clustering of pre-B cell integrins induces galectin-1-dependent pre-B cell receptor relocalization and activation". Journal of Immunology. 177 (2): 796—803. doi:10.4049/jimmunol.177.2.796. PMID 16818733.
Перейти к шаблону «Кластеры дифференцировки»
1-50
51-100
101-150
151-200
201-250
251-300
301-350
351-400