BCAM

BCAM
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

2PET, 2PF6

Идентификаторы
ПсевдонимыBCAM, AU, CD239, LU, MSK19, basal cell adhesion molecule (Lutheran blood group)
Внешние IDOMIM: 612773 MGI: 1929940 HomoloGene: 21149 GeneCards: BCAM
Расположение гена (человек)
19-я хромосома человека
Хр.19-я хромосома человека[1]
19-я хромосома человека
Расположение в геноме BCAM
Расположение в геноме BCAM
Локус19q13.32Начало44,809,071 bp[1]
Конец44,821,421 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
7-я хромосома мыши
Хр.7-я хромосома мыши[2]
7-я хромосома мыши
Расположение в геноме BCAM
Расположение в геноме BCAM
Локус7|7 A3Начало19,490,056 bp[2]
Конец19,504,941 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
  • right uterine tube

  • left lobe of thyroid gland

  • popliteal artery

  • right lobe of thyroid gland

  • left uterine tube
Наибольшая экспрессия в
  • interventricular septum

  • right lung lobe

  • left lung lobe

  • cardiac muscles
Дополнительные справочные данные
BioGPS


Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
  • laminin receptor activity
  • protein C-terminus binding
  • связывание с белками плазмы
  • laminin binding
  • transmembrane signaling receptor activity
Компонент клетки
  • часть мембраны
  • поверхность клетки
  • клеточная мембрана
  • часть клеточной мембраны
  • экзосома
  • мембрана
  • наружная сторона клеточной мембраны
  • внеклеточный матрикс
  • внеклеточная область
  • collagen-containing extracellular matrix
Биологический процесс
  • агрегация клеток
  • cell-matrix adhesion
  • передача сигнала
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

4059

57278

Ensembl

ENSG00000187244

ENSMUSG00000002980

UniProt

P50895

Q9R069

RefSeq (мРНК)

NM_005581
NM_001013257

NM_020486

RefSeq (белок)

NP_001013275
NP_005572

NP_065232

Локус (UCSC)Chr 19: 44.81 – 44.82 MbChr 7: 19.49 – 19.5 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

BCAM (англ. Basal cell adhesion molecule; CD239), или «лютеранский антиген» — мембранный белок, гликопротеин суперсемейства иммуноглобулинов, молекула клеточной адгезии, продукт гена BCAM[5]. Антиген группы крови Lutheran. Антиген b группы крови Auberger.

Функции

Этот белок клеточной адгезии составляет основу системы групп крови Lutheran. Рецептор белка внеклеточного матрикса ламинина. Белок может играть роль в раке эпителиальных клеток и в сосудистой окклюзии эритроцитов при серповидноклеточной анемии[5].

Тканевая локализация

Белок экспрессируют эритроидные клетки, а также некоторые стволовые клетки.

Структура

Белок состоит из 628 аминокислот, молекулярная масса 67,4 кДа. Включает 5 N-концевых внеклеточных иммуноглобулиновых доменов, единственный трансмембранный участок и короткий внутриклеточный фрагмент. Образует две изофромы[5].

Взаимодействия

BCAM взаимодействует с ламининовой цепью альфа 5[6][7].

Литература

  • Eyler C. E., Telen M. J. The Lutheran glycoprotein: a multifunctional adhesion receptor (англ.) // Transfusion : journal. — 2006. — Vol. 46, no. 4. — P. 668—677. — doi:10.1111/j.1537-2995.2006.00779.x. — PMID 16584446.
  • Lewis M., Kaita H., Coghlan G. et al. The chromosome 19 linkage group LDLR, C3, LW, APOC2, LU, SE in man (англ.) // Ann. Hum. Genet.[англ.] : journal. — 1989. — Vol. 52, no. Pt 2. — P. 137—144. — doi:10.1111/j.1469-1809.1988.tb01089.x. — PMID 2907851.
  • Parsons S. F., Mallinson G., Holmes C. H. et al. The Lutheran blood group glycoprotein, another member of the immunoglobulin superfamily, is widely expressed in human tissues and is developmentally regulated in human liver (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1995. — Vol. 92, no. 12. — P. 5496—5500. — doi:10.1073/pnas.92.12.5496. — PMID 7777537. — PMC 41722.
  • Campbell I. G., Foulkes W. D., Senger G. et al. Molecular cloning of the B-CAM cell surface glycoprotein of epithelial cancers: a novel member of the immunoglobulin superfamily (англ.) // Cancer Research[англ.] : journal. — American Association for Cancer Research[англ.], 1994. — Vol. 54, no. 22. — P. 5761—5765. — PMID 7954395.
  • Rahuel C., Le Van Kim C., Mattei M. G. et al. A unique gene encodes spliceoforms of the B-cell adhesion molecule cell surface glycoprotein of epithelial cancer and of the Lutheran blood group glycoprotein (англ.) // Blood[англ.] : journal. — American Society of Hematology[англ.], 1996. — Vol. 88, no. 5. — P. 1865—1872. — PMID 8781446.
  • Parsons S. F., Mallinson G., Daniels G. L. et al. Use of domain-deletion mutants to locate Lutheran blood group antigens to each of the five immunoglobulin superfamily domains of the Lutheran glycoprotein: elucidation of the molecular basis of the Lu(a)/Lu(b) and the Au(a)/Au(b) polymorphisms (англ.) // Blood[англ.] : journal. — American Society of Hematology[англ.], 1997. — Vol. 89, no. 11. — P. 4219—4225. — PMID 9166867.
  • El Nemer W., Rahuel C., Colin Y. et al. Organization of the human LU gene and molecular basis of the Lu(a)/Lu(b) blood group polymorphism (англ.) // Blood[англ.] : journal. — American Society of Hematology[англ.], 1997. — Vol. 89, no. 12. — P. 4608—4616. — PMID 9192786.
  • Parsons S. F., Lee G., Spring F. A. et al. Lutheran blood group glycoprotein and its newly characterized mouse homologue specifically bind alpha5 chain-containing human laminin with high affinity (англ.) // Blood[англ.] : journal. — American Society of Hematology[англ.], 2001. — Vol. 97, no. 1. — P. 312—320. — doi:10.1182/blood.V97.1.312. — PMID 11133776.
  • El Nemer W., Gane P., Colin Y. et al. Characterization of the laminin binding domains of the Lutheran blood group glycoprotein (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2001. — Vol. 276, no. 26. — P. 23757—23762. — doi:10.1074/jbc.M102978200. — PMID 11319237.
  • Kikkawa Y., Moulson C. L., Virtanen I., Miner J. H. Identification of the binding site for the Lutheran blood group glycoprotein on laminin alpha 5 through expression of chimeric laminin chains in vivo (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2003. — Vol. 277, no. 47. — P. 44864—44869. — doi:10.1074/jbc.M208731200. — PMID 12244066.
  • Strausberg R. L., Feingold E. A., Grouse L. H. et al. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — PMID 12477932. — PMC 139241.
  • Shin B. K., Wang H., Yim A. M. et al. Global profiling of the cell surface proteome of cancer cells uncovers an abundance of proteins with chaperone function (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2003. — Vol. 278, no. 9. — P. 7607—7616. — doi:10.1074/jbc.M210455200. — PMID 12493773.
  • Zhang H., Li X. J., Martin D. B., Aebersold R. Identification and quantification of N-linked glycoproteins using hydrazide chemistry, stable isotope labeling and mass spectrometry (англ.) // Nature Biotechnology : journal. — Nature Publishing Group, 2003. — Vol. 21, no. 6. — P. 660—666. — doi:10.1038/nbt827. — PMID 12754519.
  • Crew V. K., Green C., Daniels G. Molecular bases of the antigens of the Lutheran blood group system (англ.) // Transfusion : journal. — 2004. — Vol. 43, no. 12. — P. 1729—1737. — doi:10.1111/j.0041-1132.2003.00600.x. — PMID 14641871.
  • Zen Q., Batchvarova M., Twyman C. A. et al. B-CAM/LU expression and the role of B-CAM/LU activation in binding of low- and high-density red cells to laminin in sickle cell disease (англ.) // Am. J. Hematol.[англ.] : journal. — 2004. — Vol. 75, no. 2. — P. 63—72. — doi:10.1002/ajh.10442. — PMID 14755370.
  • Kroviarski Y., El Nemer W., Gane P. et al. Direct interaction between the Lu/B-CAM adhesion glycoproteins and erythroid spectrin (англ.) // Br. J. Haematol.[англ.] : journal. — 2004. — Vol. 126, no. 2. — P. 255—264. — doi:10.1111/j.1365-2141.2004.05010.x. — PMID 15238148.
  • Drewniok C., Wienrich B. G., Schön M. et al. Molecular interactions of B-CAM (basal-cell adhesion molecule) and laminin in epithelial skin cancer (англ.) // Arch. Dermatol. Res. : journal. — 2005. — Vol. 296, no. 2. — P. 59—66. — doi:10.1007/s00403-004-0481-4. — PMID 15278364.
  • Gerhard D. S., Wagner L., Feingold E. A. et al. The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC) (англ.) // Genome Res.[англ.] : journal. — 2004. — Vol. 14, no. 10B. — P. 2121—2127. — doi:10.1101/gr.2596504. — PMID 15489334. — PMC 528928.
  • Cheng J., Kapranov P., Drenkow J. et al. Transcriptional maps of 10 human chromosomes at 5-nucleotide resolution (англ.) // Science : journal. — 2005. — Vol. 308, no. 5725. — P. 1149—1154. — doi:10.1126/science.1108625. — PMID 15790807.
  • Vainionpää N., Kikkawa Y., Lounatmaa K. et al. Laminin-10 and Lutheran blood group glycoproteins in adhesion of human endothelial cells (англ.) // American Physiological Society[англ.] : journal. — 2006. — Vol. 290, no. 3. — P. C764—75. — doi:10.1152/ajpcell.00285.2005. — PMID 16236823.

Примечания

  1. 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000187244 - Ensembl, May 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000002980 - Ensembl, May 2017
  3. Ссылка на публикацию человека на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. Ссылка на публикацию мыши на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. 1 2 3 Entrez Gene: BCAM basal cell adhesion molecule (Lutheran blood group)  (неопр.).
  6. Parsons S. F., Lee G., Spring F. A., Willig T. N., Peters L. L., Gimm J. A., Tanner M. J., Mohandas N., Anstee D. J., Chasis J. A. Lutheran blood group glycoprotein and its newly characterized mouse homologue specifically bind alpha5 chain-containing human laminin with high affinity (англ.) // Blood[англ.] : journal. — American Society of Hematology[англ.], 2001. — Vol. 97, no. 1. — P. 312—320. — doi:10.1182/blood.v97.1.312. — PMID 11133776.
  7. Kikkawa Y., Moulson C. L., Virtanen I., Miner J. H. Identification of the binding site for the Lutheran blood group glycoprotein on laminin alpha 5 through expression of chimeric laminin chains in vivo (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2002. — Vol. 277, no. 47. — P. 44864—44869. — doi:10.1074/jbc.M208731200. — PMID 12244066.
Перейти к шаблону «Кластеры дифференцировки»
1-50
51-100
101-150
151-200
201-250
251-300
301-350
351-400