CLEC4C

CLEC4C
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

3WBP, 3WBQ, 3WBR, 4ZES, 4ZET

Идентификаторы
ПсевдонимыCLEC4C, BDCA2, CD303, CLECSF11, CLECSF7, DLEC, HECL, PRO34150, C-type lectin domain family 4 member C, BDCA-2
Внешние IDOMIM: 606677 MGI: 1917060 HomoloGene: 130350 GeneCards: CLEC4C
Расположение гена (человек)
12-я хромосома человека
Хр.12-я хромосома человека[1]
12-я хромосома человека
Расположение в геноме CLEC4C
Расположение в геноме CLEC4C
Локус12p13.31Начало7,729,383 bp[1]
Конец7,751,605 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
6-я хромосома мыши
Хр.6-я хромосома мыши[2]
6-я хромосома мыши
Расположение в геноме CLEC4C
Расположение в геноме CLEC4C
Локус6|6 F2Начало123,026,921 bp[2]
Конец123,048,514 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
  • secondary oocyte
Наибольшая экспрессия в
  • subcutaneous adipose tissue

  • skin of abdomen

  • right lung lobe
Дополнительные справочные данные
BioGPS
н/д
Генная онтология
Молекулярная функция
  • связывание углеводов
  • связывание с ионом металла
Компонент клетки
  • часть мембраны
  • мембрана
  • secretory granule membrane
  • tertiary granule membrane
  • ficolin-1-rich granule membrane
  • клеточная мембрана
Биологический процесс
  • stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway
  • adaptive immune response
  • immune system process
  • врождённый иммунитет
  • neutrophil degranulation
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

170482

69810

Ensembl

ENSG00000198178

ENSMUSG00000030147

UniProt

Q8WTT0

н/д

RefSeq (мРНК)

NM_203503
NM_130441
NM_001371390
NM_001371391

NM_001190310
NM_027218

RefSeq (белок)

NP_569708
NP_987099
NP_001358319
NP_001358320

н/д

Локус (UCSC)Chr 12: 7.73 – 7.75 MbChr 6: 123.03 – 123.05 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

CLEC4C (англ. C-type lectin domain family 4 member C, лектин С-типа домен семейство 4 член C; CD303) — мембранный белок, экспрессирован на плазмацитоидных дендритных клетках. Продукт гена человека CLEC4C[5].

Функции

Белок является мембранным белком класса лектинов типа С. Играет роль в связывании антигена дендритными клетками. Специфически распознаёт несиалированные биантеннарные гликаны с концевой галактозой, содержащие трисахаридный эпитоп Gal(beta1-3/4)GlcNAc(beta1-2)Man. Связывается с иммуноглобулином G (IgG). Доставляет лиганд в клеточные компартменты, отвечающие за процессирование антигена и загрузку пептидов для дальнейшей презентации T-клеткам. Может опосредовать сильный ингибирующий эффект на экспрессию интерферонов альфа и бета плазмацитоидными дендритными клетками. Действует как сигнальный рецептор, активирующий тирозинкиназы.

Структура

CLEC4C состоит из 213 аминокислот, содержит 3 участка гликозилирования и 4 дисульфидные связи.

Тканевая специфичность

Белок экспрессирован на плазмацитоидных дендритных клетках. Присутствует на незрелых дендритных клетках моноцитарного происхождения, затем экспрессия блокируется в процессе созревания клеток под действием липополисахарида, но не TNF.

Примечания

  1. 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000198178 - Ensembl, May 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000030147 - Ensembl, May 2017
  3. Ссылка на публикацию человека на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. Ссылка на публикацию мыши на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. Dzionek A., Sohma Y., Nagafune J. et al. BDCA-2, a novel plasmacytoid dendritic cell-specific type II C-type lectin, mediates antigen capture and is a potent inhibitor of interferon alpha/beta induction (англ.) // Journal of Experimental Medicine[англ.] : journal. — Rockefeller University Press[англ.], 2001. — December (vol. 194, no. 12). — P. 1823—1834. — doi:10.1084/jem.194.12.1823. — PMID 11748283. — PMC 2193584. Архивировано 17 марта 2020 года.
Перейти к шаблону «Кластеры дифференцировки»
1-50
51-100
101-150
151-200
201-250
251-300
301-350
351-400