SMC4

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4U4P

Ідентифікатори

Символи

SMC4, CAP-C, CAPC, SMC-4, SMC4L1, hCAP-C, structural maintenance of chromosomes 4

Зовнішні ІД

OMIM: 605575 MGI: 1917349 HomoloGene: 4015 GeneCards: SMC4

Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein heterodimerization activity • nucleotide binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • single-stranded DNA binding
Клітинна компонента	• хромосома • клітинне ядро • Конденсин • нуклеоплазма • цитоплазма • гіалоплазма • nuclear speck
Біологічний процес	• mitotic sister chromatid segregation • meiotic chromosome segregation • поділ клітини • клітинний цикл • kinetochore organization • mitotic chromosome condensation • meiotic chromosome condensation • chromosome condensation • GO:0051312, GO:0007083 chromosome organization
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


10051


70099

Ensembl


ENSG00000113810


ENSMUSG00000034349

UniProt


Q9NTJ3


Q8CG47

RefSeq (мРНК)


NM_001002799 NM_001002800 NM_001288753 NM_005496


NM_133786 NM_001356976

RefSeq (білок)


NP_001002800 NP_001275682 NP_005487


NP_598547 NP_001343905

Локус (UCSC)

Хр. 3: 160.4 – 160.43 Mb

Хр. 3: 68.91 – 68.94 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SMC4 (англ. Structural maintenance of chromosomes 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 288 амінокислот, а молекулярна маса — 147 182^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPRKGTQPST	ARRREEGPPP	PSPDGASSDA	EPEPPSGRTE	SPATAAETAS
EELDNRSLEE	ILNSIPPPPP	PAMTNEAGAP	RLMITHIVNQ	NFKSYAGEKI
LGPFHKRFSC	IIGPNGSGKS	NVIDSMLFVF	GYRAQKIRSK	KLSVLIHNSD
EHKDIQSCTV	EVHFQKIIDK	EGDDYEVIPN	SNFYVSRTAC	RDNTSVYHIS
GKKKTFKDVG	NLLRSHGIDL	DHNRFLILQG	EVEQIAMMKP	KGQTEHDEGM
LEYLEDIIGC	GRLNEPIKVL	CRRVEILNEH	RGEKLNRVKM	VEKEKDALEG
EKNIAIEFLT	LENEIFRKKN	HVCQYYIYEL	QKRIAEMETQ	KEKIHEDTKE
INEKSNILSN	EMKAKNKDVK	DTEKKLNKIT	KFIEENKEKF	TQLDLEDVQV
REKLKHATSK	AKKLEKQLQK	DKEKVEEFKS	IPAKSNNIIN	ETTTRNNALE
KEKEKEEKKL	KEVMDSLKQE	TQGLQKEKES	REKELMGFSK	SVNEARSKMD
VAQSELDIYL	SRHNTAVSQL	TKAKEALIAA	SETLKERKAA	IRDIEGKLPQ
TEQELKEKEK	ELQKLTQEET	NFKSLVHDLF	QKVEEAKSSL	AMNRSRGKVL
DAIIQEKKSG	RIPGIYGRLG	DLGAIDEKYD	VAISSCCHAL	DYIVVDSIDI
AQECVNFLKR	QNIGVATFIG	LDKMAVWAKK	MTEIQTPENT	PRLFDLVKVK
DEKIRQAFYF	ALRDTLVADN	LDQATRVAYQ	KDRRWRVVTL	QGQIIEQSGT
MTGGGSKVMK	GRMGSSLVIE	ISEEEVNKME	SQLQNDSKKA	MQIQEQKVQL
EERVVKLRHS	EREMRNTLEK	FTASIQRLIE	QEEYLNVQVK	ELEANVLATA
PDKKKQKLLE	ENVSAFKTEY	DAVAEKAGKV	EAEVKRLHNT	IVEINNHKLK
AQQDKLDKIN	KQLDECASAI	TKAQVAIKTA	DRNLQKAQDS	VLRTEKEIKD
TEKEVDDLTA	ELKSLEDKAA	EVVKNTNAAE	ESLPEIQKEH	RNLLQELKVI
QENEHALQKD	ALSIKLKLEQ	IDGHIAEHNS	KIKYWHKEIS	KISLHPIEDN
PIEEISVLSP	EDLEAIKNPD	SITNQIALLE	ARCHEMKPNL	GAIAEYKKKE
ELYLQRVAEL	DKITYERDSF	RQAYEDLRKQ	RLNEFMAGFY	IITNKLKENY
QMLTLGGDAE	LELVDSLDPF	SEGIMFSVRP	PKKSWKKIFN	LSGGEKTLSS
LALVFALHHY	KPTPLYFMDE	IDAALDFKNV	SIVAFYIYEQ	TKNAQFIIIS
LRNNMFEISD	RLIGIYKTYN	ITKSVAVNPK	EIASKGLC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинний цикл, поділ клітини, мітоз, конденсація ДНК, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, хромосомах.

Література

Schmiesing J.A., Gregson H.C., Zhou S., Yokomori K. (2000). A human condensin complex containing hCAP-C-hCAP-E and CNAP1, a homolog of Xenopus XCAP-D2, colocalizes with phosphorylated histone H3 during the early stage of mitotic chromosome condensation. Mol. Cell. Biol. 20: 6996—7006. PMID 10958694 DOI:10.1128/MCB.20.18.6996-7006.2000
Kimura K., Cuvier O., Hirano T. (2001). Chromosome condensation by a human condensin complex in Xenopus egg extracts. J. Biol. Chem. 276: 5417—5420. PMID 11136719 DOI:10.1074/jbc.C000873200
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14013 (англ.) . Архів оригіналу за 10 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9NTJ3 (англ.) . Архів оригіналу за 26 лютого 2018. Процитовано 30 серпня 2017.