GNA13

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1SHZ, 1ZCB, 3AB3, 3CX6, 3CX7, 3CX8

Ідентифікатори

Символи

GNA13, G13, G protein subunit alpha 13, HG1N

Зовнішні ІД

OMIM: 604406 MGI: 95768 HomoloGene: 55976 GeneCards: GNA13

Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding • G-protein beta/gamma-subunit complex binding • type 1 angiotensin receptor binding • GTP binding • D5 dopamine receptor binding • signal transducer activity • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • guanyl nucleotide binding • G protein-coupled receptor binding • guanyl-nucleotide exchange factor activity • GO:0006184 GTPase activity
Клітинна компонента	• мембрана • focal adhesion • Меланосома • brush border membrane • heterotrimeric G-protein complex • екзосома • клітинне ядро • цитоплазма • гіалоплазма • клітинна мембрана
Біологічний процес	• диференціація клітин • GO:0007243 intracellular signal transduction • regulation of cell migration • adenylate cyclase-activating G protein-coupled receptor signaling pathway • positive regulation of cytosolic calcium ion concentration • small GTPase mediated signal transduction • in utero embryonic development • platelet activation • activation of phospholipase D activity • Rho protein signal transduction • Ангіогенез • regulation of cell shape • branching involved in blood vessel morphogenesis • GO:0072468 сигнальна трансдукція • positive regulation of apoptotic process • regulation of small GTPase mediated signal transduction • G protein-coupled receptor signaling pathway • adenylate cyclase-modulating G protein-coupled receptor signaling pathway
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


10672


14674

Ensembl


ENSG00000120063


ENSMUSG00000020611

UniProt


Q14344


P27601

RefSeq (мРНК)


NM_001282425 NM_006572


NM_010303 NM_001359034

RefSeq (білок)


NP_001269354 NP_006563


NP_034433 NP_001345963

Локус (UCSC)

Хр. 17: 65.01 – 65.06 Mb

Хр. 11: 109.25 – 109.29 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

GNA13 (англ. G protein subunit alpha 13) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 377 амінокислот, а молекулярна маса — 44 050^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MADFLPSRSV	LSVCFPGCLL	TSGEAEQQRK	SKEIDKCLSR	EKTYVKRLVK
ILLLGAGESG	KSTFLKQMRI	IHGQDFDQRA	REEFRPTIYS	NVIKGMRVLV
DAREKLHIPW	GDNSNQQHGD	KMMSFDTRAP	MAAQGMVETR	VFLQYLPAIR
ALWADSGIQN	AYDRRREFQL	GESVKYFLDN	LDKLGEPDYI	PSQQDILLAR
RPTKGIHEYD	FEIKNVPFKM	VDVGGQRSER	KRWFECFDSV	TSILFLVSSS
EFDQVLMEDR	LTNRLTESLN	IFETIVNNRV	FSNVSIILFL	NKTDLLEEKV
QIVSIKDYFL	EFEGDPHCLR	DVQKFLVECF	RNKRRDQQQK	PLYHHFTTAI
NTENIRLVFR	DVKDTILHDN	LKQLMLQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків внутрішньоклітинного сигналінгу, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, іонами металів, ГТФ, іоном магнію. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані.

Література

Kabouridis P.S., Waters S.T., Escobar S., Stanners J., Tsoukas C.D. (1995). Expression of GTP-binding protein alpha subunits in human thymocytes. Mol. Cell. Biochem. 144: 45—51. PMID 7791744 DOI:10.1007/BF00926739
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Fukuhara S., Murga C., Zohar M., Igishi T., Gutkind J.S. (1999). A novel PDZ domain containing guanine nucleotide exchange factor links heterotrimeric G proteins to Rho. J. Biol. Chem. 274: 5868—5879. PMID 10026210 DOI:10.1074/jbc.274.9.5868
Fukuhara S., Chikumi H., Gutkind J.S. (2000). Leukemia-associated Rho guanine nucleotide exchange factor (LARG) links heterotrimeric G proteins of the G(12) family to Rho. FEBS Lett. 485: 183—188. PMID 11094164 DOI:10.1016/S0014-5793(00)02224-9
Bhattacharyya R., Wedegaertner P.B. (2000). Galpha 13 requires palmitoylation for plasma membrane localization, Rho-dependent signaling, and promotion of p115-RhoGEF membrane binding. J. Biol. Chem. 275: 14992—14999. PMID 10747909 DOI:10.1074/jbc.M000415200
Meigs T.E., Fedor-Chaiken M., Kaplan D.D., Brackenbury R., Casey P.J. (2002). Galpha12 and Galpha13 negatively regulate the adhesive functions of cadherin. J. Biol. Chem. 277: 24594—24600. PMID 11976333 DOI:10.1074/jbc.M201984200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4381 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q14344 (англ.) . Архів оригіналу за 31 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.