GABBR1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4MQE, 4MQF, 4MR7, 4MR9, 4MRM, 4MS1, 4MS3, 4MS4, 4PAS

Ідентифікатори

Символи

GABBR1, GABABR1, GABBR1-3, GB1, GPRC3A, dJ271M21.1.1, dJ271M21.1.2, gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 1

Зовнішні ІД

OMIM: 603540 MGI: 1860139 HomoloGene: 1132 GeneCards: GABBR1

Реагує на сполуку

arbaclofen placarbil, Гамма-оксимасляна кислота, arbaclofen, sgs-742^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• G protein-coupled receptor activity • signal transducer activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • G protein-coupled GABA receptor activity • G protein-coupled neurotransmitter receptor activity involved in regulation of postsynaptic membrane potential
Клітинна компонента	• цитоплазма • integral component of membrane • G protein-coupled receptor dimeric complex • postsynaptic membrane • cell projection • мембрана • клітинна мембрана • синапс • integral component of plasma membrane • extracellular region • міжклітинні контакти • дендрит (нейробіологія) • G protein-coupled receptor heterodimeric complex • presynaptic membrane • presynapse • Schaffer collateral - CA1 synapse • GABA-ergic synapse
Біологічний процес	• gamma-aminobutyric acid signaling pathway • adenylate cyclase-inhibiting G protein-coupled receptor signaling pathway • GO:0072468 сигнальна трансдукція • negative regulation of adenylate cyclase activity • G protein-coupled receptor signaling pathway • regulation of postsynaptic membrane potential • neuron-glial cell signaling
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


2550


54393

Ensembl

ENSG00000237112 ENSG00000206511 ENSG00000206466 ENSG00000232632 ENSG00000232569
ENSG00000237051 ENSG00000204681


ENSMUSG00000024462

UniProt


Q9UBS5


Q9WV18

RefSeq (мРНК)


NM_001470 NM_021903 NM_021904 NM_021905 NM_001319053


NM_019439

RefSeq (білок)


NP_001305982 NP_001461 NP_068703 NP_068704


NP_062312

Локус (UCSC)

Хр. 6: 29.56 – 29.63 Mb

Хр. 17: 37.36 – 37.39 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

GABBR1 (англ. Gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 961 амінокислот, а молекулярна маса — 108 320^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLLLLLLAPL	FLRPPGAGGA	QTPNATSEGC	QIIHPPWEGG	IRYRGLTRDQ
VKAINFLPVD	YEIEYVCRGE	REVVGPKVRK	CLANGSWTDM	DTPSRCVRIC
SKSYLTLENG	KVFLTGGDLP	ALDGARVDFR	CDPDFHLVGS	SRSICSQGQW
STPKPHCQVN	RTPHSERRAV	YIGALFPMSG	GWPGGQACQP	AVEMALEDVN
SRRDILPDYE	LKLIHHDSKC	DPGQATKYLY	ELLYNDPIKI	ILMPGCSSVS
TLVAEAARMW	NLIVLSYGSS	SPALSNRQRF	PTFFRTHPSA	TLHNPTRVKL
FEKWGWKKIA	TIQQTTEVFT	STLDDLEERV	KEAGIEITFR	QSFFSDPAVP
VKNLKRQDAR	IIVGLFYETE	ARKVFCEVYK	ERLFGKKYVW	FLIGWYADNW
FKIYDPSINC	TVDEMTEAVE	GHITTEIVML	NPANTRSISN	MTSQEFVEKL
TKRLKRHPEE	TGGFQEAPLA	YDAIWALALA	LNKTSGGGGR	SGVRLEDFNY
NNQTITDQIY	RAMNSSSFEG	VSGHVVFDAS	GSRMAWTLIE	QLQGGSYKKI
GYYDSTKDDL	SWSKTDKWIG	GSPPADQTLV	IKTFRFLSQK	LFISVSVLSS
LGIVLAVVCL	SFNIYNSHVR	YIQNSQPNLN	NLTAVGCSLA	LAAVFPLGLD
GYHIGRNQFP	FVCQARLWLL	GLGFSLGYGS	MFTKIWWVHT	VFTKKEEKKE
WRKTLEPWKL	YATVGLLVGM	DVLTLAIWQI	VDPLHRTIET	FAKEEPKEDI
DVSILPQLEH	CSSRKMNTWL	GIFYGYKGLL	LLLGIFLAYE	TKSVSTEKIN
DHRAVGMAIY	NVAVLCLITA	PVTMILSSQQ	DAAFAFASLA	IVFSSYITLV
VLFVPKMRRL	ITRGEWQSEA	QDTMKTGSST	NNNEEEKSRL	LEKENRELEK
IIAEKEERVS	ELRHQLQSRQ	QLRSRRHPPT	PPEPSGGLPR	GPPEPPDRLS
CDGSRVHLLY	K

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, g-білокспряжених рецепторів, білків внутрішньоклітинного сигналінгу, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках, синапсах. Також секретований назовні.

Література

Makoff A. (1999). Molecular cloning of human GABABR1 and its tissue distribution. Brain Res. Mol. Brain Res. 64: 137—140. PMID 9889352 DOI:10.1016/S0169-328X(98)00316-7
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Hillman R.T., Green R.E., Brenner S.E. (2004). An unappreciated role for RNA surveillance. Genome Biol. 5: R8.1—R8.16. PMID 14759258 DOI:10.1186/gb-2004-5-2-r8
Nomura R., Suzuki Y., Kakizuka A., Jingami H. (2008). Direct detection of the interaction between recombinant soluble extracellular regions in the heterodimeric metabotropic gamma-aminobutyric acid receptor. J. Biol. Chem. 283: 4665—4673. PMID 18165688 DOI:10.1074/jbc.M705202200
Geng Y., Bush M., Mosyak L., Wang F., Fan Q.R. (2013). Structural mechanism of ligand activation in human GABA(B) receptor. Nature. 504: 254—259. PMID 24305054 DOI:10.1038/nature12725

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4070 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9UBS5 (англ.) . Архів оригіналу за 2 жовтня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 6

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Трансмембранні рецептори: G-білокспряжені рецептори

Клас A: Родопсин-подібні

Рецептори нейромедіаторів

Адренорецептори	α1 A B D α2 A B C β1 β2 β3

Пуринові рецептори	Аденозинові рецептори A1 A2A A2B A3 P2Y 1 2 4 5 6 8 9 10 11 12 13 14

Серотонінові рецептори	(крім 5-HT3) 5-HT1 A B D E F) 5-HT2 A B C 5-HT 4 5A 6 7)

Інші	Мускариновий ацетилхоліновий рецептор M1 M2 M3 M4 M5 Дофамінові рецептори D1 D2 D3 D4 D5 GHB-рецептор Гістамінові рецептори H1 H2 H3 H4 Мелатонінові рецептори 1A 1B 1C TAAR 1 2 5 6 8 9

Метаболіти та
сигнальні молекули

Ейкозаноїдні рецептори	CysLT 1 2 LTB4 1 2 FPR2 OXER1 Простагландинові рецептори DP 1 2 EP 1 2 3 4) FP PTGIR TBXA2R

Інші	Жовчні кислоти Канабіноїдні рецептори CB1 CB2 GPR 18 55 119 EBI2 Естроген Рецептори вільних жирних кислот 1 2 3 4 HCAR 1 2 3 LPAR 1 2 3 4 5 6 S1PR 1 2 3 4 5 OXGR1 PTAFR SUCNR1

Пептиди

Рецептори нейропептидів	B/W 1 2 FF 1 2 S Y 1 2 4 5 Нейромедин B U 1 2 Нейротенсин 1 2

Інші	Анафілатоксин C3a C5a 1 2 Ангіатонзин 1 2 Апелін Бомбезин BRS3 GRPR NMBR Брадикинін B1 B2 Хемокиновий рецептор Холецистокинін A B Ендотилін A B FPR 1 2 3 FSHR Галанін 1 2 3 GNRHR 1 2 GHSR KISS1R LHCGR MAS 1 1L D E F G X1 X2 X3 X4 Меланокортин 1 2 3 4 5 MCHR 1 2 MLNR Опіати Δ Κ Μ OPRL1 OGFR Орексин 1 2 Окситоцин Прокінетецин 1 2 PRLHR Релаксин 1 2 3 4 Рецептори соматостатинів 1 2 3 4 5 Тахінін 1 2 3 Рецептор тиреотропного гормону TRHR UTS2R Рецептори вазопресину 1A 1B 2

Різні

Смак, гірке	TAS2R 1 3 4 5 7 8 9 10 13 14 16 19 20 30 31 38 39 40 41 42 43 45 46 50 60 VN1R 1 2 3 4 5

Орфанні	GPR (1 3 4 6 12 15 17 18 19 20 21 22 23 25 26 27 31 32 33 34 35 37 39 42 44 45 50 52 55 61 62 63 65 68 75 77 78 81 82 83 84 85 87 88 92 101 103 109A 109B 119 120 132 135 137B 139 141 142 146 148 149 150 151 152 153 160 161 162 171 173 174 176 177 182 183)

Інші	GPR182 Запах Опсин 3 4 5 1LW 1MW 1SW RGR RRH F2R 1 2 3 4 SREB 1 2 3

Клас B: Секретин-подібні

Адгезивні	ADGRG 1 2 3 4 5 6 7

Орфанні	GPR (56 64 97 98 110 111 112 113 114 115 116 123 124 125 126 128 133 143 144 155 157)

Інші	ADGRB 1 2 3 CELSR 1 2 3 Кальцитонін CALCRL ADGRE5 CRHR 1 2 EMR 1 2 3 Глюкагон GR GIPR GLP1R GLP2R GHRHR PACAPR1 Латрофілін 1 2 3 4 PTH 1 2 SCTR VIPR 1 2

Клас C: Метаботропні глутаматні рецептори / феромони

Смак, солодке	TAS1R 1 2 3 VN2R

Other	CASR ГАМК-рецептори 1 2 Глутаматні рецептори Метаботропні глутаматні 1 2 3 4 5 6 7 8 GPRC6A GPR 156 158 179 RAIG 1 2 3 4