Інтегрин, ізоформа бета-1

Інтегрин, ізоформа бета-1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

4WK4, 3G9W, 3T9K, 3VI3, 3VI4, 4DX9, 4WJK, 4WK0, 4WK2

Ідентифікатори
Символи ITGB1, CD29, FNRB, GPIIA, MDF2, MSK12, VLA-BETA, VLAB, integrin subunit beta 1
Зовнішні ІД OMIM: 135630 MGI: 96610 HomoloGene: 22999 GeneCards: ITGB1
Онтологія гена
Молекулярна функція

• virus receptor activity
• зв'язування з іоном металу
• integrin binding
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• laminin binding
• cell adhesion molecule binding
• collagen binding involved in cell-matrix adhesion
• coreceptor activity
• protease binding
• fibronectin binding
• actin binding
• C-X3-C chemokine binding
• protein heterodimerization activity
• GO:0032403 protein-containing complex binding
• cadherin binding
• signaling receptor activity

Клітинна компонента

• цитоплазма
• ендосома
• мембрана
• Меланосома
• ruffle
• integrin alpha8-beta1 complex
• синапс
• ruffle membrane
• integrin complex
• perinuclear region of cytoplasm
• cell projection
• dendritic spine
• cell surface
• Борозна розщеплення
• integrin alpha7-beta1 complex
• екзосома
• lamellipodium
• integral component of membrane
• recycling endosome
• integrin alpha1-beta1 complex
• intercalated disc
• Філоподія
• neuromuscular junction
• receptor complex
• клітинна мембрана
• integrin alpha11-beta1 complex
• myelin sheath abaxonal region
• synaptic membrane
• integrin alpha10-beta1 complex
• міжклітинні контакти
• integrin alpha2-beta1 complex
• Сарколема
• external side of plasma membrane
• GO:0016023 cytoplasmic vesicle
• integrin alpha3-beta1 complex
• membrane raft
• focal adhesion
• glial cell projection
• Schaffer collateral - CA1 synapse
• glutamatergic synapse
• integral component of synaptic membrane
• GO:0009327 protein-containing complex

Біологічний процес

• leukocyte cell-cell adhesion
• cell migration involved in sprouting angiogenesis
• stress fiber assembly
• viral entry into host cell
• B cell differentiation
• neuron projection development
• transforming growth factor beta receptor signaling pathway
• regulation of collagen catabolic process
• negative regulation of cell differentiation
• cardiac muscle cell differentiation
• cellular response to low-density lipoprotein particle stimulus
• in utero embryonic development
• cell-substrate adhesion
• GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity
• regulation of immune response
• GO:0022415 viral process
• dendrite morphogenesis
• cell fate specification
• G1 phase
• heterotypic cell-cell adhesion
• extracellular matrix organization
• cell-cell adhesion mediated by integrin
• cellular defense response
• адгезія клітин
• formation of radial glial scaffolds
• axon extension
• leukocyte tethering or rolling
• integrin-mediated signaling pathway
• cell-matrix adhesion
• sarcomere organization
• negative regulation of anoikis
• leukocyte migration
• homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules
• visual learning
• calcium-independent cell-matrix adhesion
• cardiac muscle tissue development
• negative regulation of Rho protein signal transduction
• receptor internalization
• regulation of cell cycle
• positive regulation of cell population proliferation
• positive regulation of apoptotic process
• mesodermal cell differentiation
• cell migration
• germ cell migration
• cell adhesion mediated by integrin
• basement membrane organization
• positive regulation of protein localization to plasma membrane
• G1/S transition of mitotic cell cycle
• Фагоцитоз
• cytokine-mediated signaling pathway
• cell projection organization
• lamellipodium assembly
• positive regulation of angiogenesis
• modulation of chemical synaptic transmission
• positive regulation of protein kinase B signaling
• positive regulation of signaling receptor activity
• positive regulation of cell migration

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
3688
16412
Ensembl
ENSG00000150093
ENSMUSG00000025809
UniProt
P05556
P09055
RefSeq (мРНК)
NM_002211
NM_033666
NM_033667
NM_033668
NM_033669
NM_133376
NM_010578
RefSeq (білок)
NP_002202
NP_391988
NP_596867
NP_034708
Локус (UCSC) Хр. 10: 32.9 – 33.01 Mb Хр. 8: 129.41 – 129.46 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

Інтегрин, ізоформа бета-1 (англ. Integrin subunit beta 1) – білок, який кодується геном ITGB1, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 798 амінокислот, а молекулярна маса — 88 415[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MNLQPIFWIGLISSVCCVFAQTDENRCLKANAKSCGECIQAGPNCGWCTN
STFLQEGMPTSARCDDLEALKKKGCPPDDIENPRGSKDIKKNKNVTNRSK
GTAEKLKPEDITQIQPQQLVLRLRSGEPQTFTLKFKRAEDYPIDLYYLMD
LSYSMKDDLENVKSLGTDLMNEMRRITSDFRIGFGSFVEKTVMPYISTTP
AKLRNPCTSEQNCTSPFSYKNVLSLTNKGEVFNELVGKQRISGNLDSPEG
GFDAIMQVAVCGSLIGWRNVTRLLVFSTDAGFHFAGDGKLGGIVLPNDGQ
CHLENNMYTMSHYYDYPSIAHLVQKLSENNIQTIFAVTEEFQPVYKELKN
LIPKSAVGTLSANSSNVIQLIIDAYNSLSSEVILENGKLSEGVTISYKSY
CKNGVNGTGENGRKCSNISIGDEVQFEISITSNKCPKKDSDSFKIRPLGF
TEEVEVILQYICECECQSEGIPESPKCHEGNGTFECGACRCNEGRVGRHC
ECSTDEVNSEDMDAYCRKENSSEICSNNGECVCGQCVCRKRDNTNEIYSG
KFCECDNFNCDRSNGLICGGNGVCKCRVCECNPNYTGSACDCSLDTSTCE
ASNGQICNGRGICECGVCKCTDPKFQGQTCEMCQTCLGVCAEHKECVQCR
AFNKGEKKDTCTQECSYFNITKVESRDKLPQPVQPDPVSHCKEKDVDDCW
FYFTYSVNGNNEVMVHVVENPECPTGPDIIPIVAGVVAGIVLIGLALLLI
WKLLMIIHDRREFAKFEKEKMNAKWDTGENPIYKSAVTTVVNPKYEGK

Цей білок за функціями належить до рецепторів клітини-хазяїна для входу вірусу, рецепторів, інтегринів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, взаємодія хазяїн-вірус. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію, іоном магнію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках, ендосомах.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Zhidkova N.I., Belkin A.M., Mayne R. (1995). Novel isoform of beta 1 integrin expressed in skeletal and cardiac muscle. Biochem. Biophys. Res. Commun. 214: 279—285. PMID 7545396 DOI:10.1006/bbrc.1995.2285
  • van der Flier A., Kuikman I., Baudoin C., van der Neut R., Sonnenberg A. (1995). A novel beta 1 integrin isoform produced by alternative splicing: unique expression in cardiac and skeletal muscle. FEBS Lett. 369: 340—344. PMID 7544298 DOI:10.1016/0014-5793(95)00814-P
  • Svineng G., Faessler R., Johansson S. (1998). Identification of beta1C-2, a novel variant of the integrin beta1 subunit generated by utilization of an alternative splice acceptor site in exon C. Biochem. J. 330: 1255—1263. PMID 9494094 DOI:10.1042/bj3301255
  • Lin Q., Keller R.S., Weaver B., Zisman L.S. (2004). Interaction of ACE2 and integrin beta1 in failing human heart. Biochim. Biophys. Acta. 1689: 175—178. PMID 15276642 DOI:10.1016/j.bbadis.2004.05.005
  • Sasaki T., Brakebusch C., Engel J., Timpl R. (1998). Mac-2 binding protein is a cell-adhesive protein of the extracellular matrix which self-assembles into ring-like structures and binds beta1 integrins, collagens and fibronectin. EMBO J. 17: 1606—1613. PMID 9501082 DOI:10.1093/emboj/17.6.1606

Примітки

  1. ↑ Human PubMed Reference:.
  2. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  3. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6153 (англ.) . Архів оригіналу за 25 травня 2017. Процитовано 30 січня 2017.
  4. ↑ UniProt, P05556 (англ.) . Архів оригіналу за 27 березня 2017. Процитовано 30 січня 2017.

Див. також

  • Хромосома 10

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

  • п
  • о
  • р
Білки: кластери диференціації
1-50
51-100
101-150
151-200
201-250
251-300
301-350


Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.