Інтегрин, ізоформа бета-1 |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/e/ec/Protein_ITGB1_PDB_1K11.png/250px-Protein_ITGB1_PDB_1K11.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 4WK4, 3G9W, 3T9K, 3VI3, 3VI4, 4DX9, 4WJK, 4WK0, 4WK2 | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | ITGB1, CD29, FNRB, GPIIA, MDF2, MSK12, VLA-BETA, VLAB, integrin subunit beta 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 135630 MGI: 96610 HomoloGene: 22999 GeneCards: ITGB1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • virus receptor activity • зв'язування з іоном металу • integrin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • laminin binding • cell adhesion molecule binding • collagen binding involved in cell-matrix adhesion • coreceptor activity • protease binding • fibronectin binding • actin binding • C-X3-C chemokine binding • protein heterodimerization activity • GO:0032403 protein-containing complex binding • cadherin binding • signaling receptor activity |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • ендосома • мембрана • Меланосома • ruffle • integrin alpha8-beta1 complex • синапс • ruffle membrane • integrin complex • perinuclear region of cytoplasm • cell projection • dendritic spine • cell surface • Борозна розщеплення • integrin alpha7-beta1 complex • екзосома • lamellipodium • integral component of membrane • recycling endosome • integrin alpha1-beta1 complex • intercalated disc • Філоподія • neuromuscular junction • receptor complex • клітинна мембрана • integrin alpha11-beta1 complex • myelin sheath abaxonal region • synaptic membrane • integrin alpha10-beta1 complex • міжклітинні контакти • integrin alpha2-beta1 complex • Сарколема • external side of plasma membrane • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • integrin alpha3-beta1 complex • membrane raft • focal adhesion • glial cell projection • Schaffer collateral - CA1 synapse • glutamatergic synapse • integral component of synaptic membrane • GO:0009327 protein-containing complex |
---|
Біологічний процес | • leukocyte cell-cell adhesion • cell migration involved in sprouting angiogenesis • stress fiber assembly • viral entry into host cell • B cell differentiation • neuron projection development • transforming growth factor beta receptor signaling pathway • regulation of collagen catabolic process • negative regulation of cell differentiation • cardiac muscle cell differentiation • cellular response to low-density lipoprotein particle stimulus • in utero embryonic development • cell-substrate adhesion • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • regulation of immune response • GO:0022415 viral process • dendrite morphogenesis • cell fate specification • G1 phase • heterotypic cell-cell adhesion • extracellular matrix organization • cell-cell adhesion mediated by integrin • cellular defense response • адгезія клітин • formation of radial glial scaffolds • axon extension • leukocyte tethering or rolling • integrin-mediated signaling pathway • cell-matrix adhesion • sarcomere organization • negative regulation of anoikis • leukocyte migration • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • visual learning • calcium-independent cell-matrix adhesion • cardiac muscle tissue development • negative regulation of Rho protein signal transduction • receptor internalization • regulation of cell cycle • positive regulation of cell population proliferation • positive regulation of apoptotic process • mesodermal cell differentiation • cell migration • germ cell migration • cell adhesion mediated by integrin • basement membrane organization • positive regulation of protein localization to plasma membrane • G1/S transition of mitotic cell cycle • Фагоцитоз • cytokine-mediated signaling pathway • cell projection organization • lamellipodium assembly • positive regulation of angiogenesis • modulation of chemical synaptic transmission • positive regulation of protein kinase B signaling • positive regulation of signaling receptor activity • positive regulation of cell migration |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/e/ef/PBB_GE_ITGB1_211945_s_at.png/250px-PBB_GE_ITGB1_211945_s_at.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_002211 NM_033666 NM_033667 NM_033668 NM_033669
| NM_133376 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_002202 NP_391988 NP_596867 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 10: 32.9 – 33.01 Mb | Хр. 8: 129.41 – 129.46 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
Інтегрин, ізоформа бета-1 (англ. Integrin subunit beta 1) – білок, який кодується геном ITGB1, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 798 амінокислот, а молекулярна маса — 88 415[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MNLQPIFWIG | | LISSVCCVFA | | QTDENRCLKA | | NAKSCGECIQ | | AGPNCGWCTN |
STFLQEGMPT | | SARCDDLEAL | | KKKGCPPDDI | | ENPRGSKDIK | | KNKNVTNRSK |
GTAEKLKPED | | ITQIQPQQLV | | LRLRSGEPQT | | FTLKFKRAED | | YPIDLYYLMD |
LSYSMKDDLE | | NVKSLGTDLM | | NEMRRITSDF | | RIGFGSFVEK | | TVMPYISTTP |
AKLRNPCTSE | | QNCTSPFSYK | | NVLSLTNKGE | | VFNELVGKQR | | ISGNLDSPEG |
GFDAIMQVAV | | CGSLIGWRNV | | TRLLVFSTDA | | GFHFAGDGKL | | GGIVLPNDGQ |
CHLENNMYTM | | SHYYDYPSIA | | HLVQKLSENN | | IQTIFAVTEE | | FQPVYKELKN |
LIPKSAVGTL | | SANSSNVIQL | | IIDAYNSLSS | | EVILENGKLS | | EGVTISYKSY |
CKNGVNGTGE | | NGRKCSNISI | | GDEVQFEISI | | TSNKCPKKDS | | DSFKIRPLGF |
TEEVEVILQY | | ICECECQSEG | | IPESPKCHEG | | NGTFECGACR | | CNEGRVGRHC |
ECSTDEVNSE | | DMDAYCRKEN | | SSEICSNNGE | | CVCGQCVCRK | | RDNTNEIYSG |
KFCECDNFNC | | DRSNGLICGG | | NGVCKCRVCE | | CNPNYTGSAC | | DCSLDTSTCE |
ASNGQICNGR | | GICECGVCKC | | TDPKFQGQTC | | EMCQTCLGVC | | AEHKECVQCR |
AFNKGEKKDT | | CTQECSYFNI | | TKVESRDKLP | | QPVQPDPVSH | | CKEKDVDDCW |
FYFTYSVNGN | | NEVMVHVVEN | | PECPTGPDII | | PIVAGVVAGI | | VLIGLALLLI |
WKLLMIIHDR | | REFAKFEKEK | | MNAKWDTGEN | | PIYKSAVTTV | | VNPKYEGK |
Цей білок за функціями належить до рецепторів клітини-хазяїна для входу вірусу, рецепторів, інтегринів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, взаємодія хазяїн-вірус. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію, іоном магнію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках, ендосомах.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Zhidkova N.I., Belkin A.M., Mayne R. (1995). Novel isoform of beta 1 integrin expressed in skeletal and cardiac muscle. Biochem. Biophys. Res. Commun. 214: 279—285. PMID 7545396 DOI:10.1006/bbrc.1995.2285
- van der Flier A., Kuikman I., Baudoin C., van der Neut R., Sonnenberg A. (1995). A novel beta 1 integrin isoform produced by alternative splicing: unique expression in cardiac and skeletal muscle. FEBS Lett. 369: 340—344. PMID 7544298 DOI:10.1016/0014-5793(95)00814-P
- Svineng G., Faessler R., Johansson S. (1998). Identification of beta1C-2, a novel variant of the integrin beta1 subunit generated by utilization of an alternative splice acceptor site in exon C. Biochem. J. 330: 1255—1263. PMID 9494094 DOI:10.1042/bj3301255
- Lin Q., Keller R.S., Weaver B., Zisman L.S. (2004). Interaction of ACE2 and integrin beta1 in failing human heart. Biochim. Biophys. Acta. 1689: 175—178. PMID 15276642 DOI:10.1016/j.bbadis.2004.05.005
- Sasaki T., Brakebusch C., Engel J., Timpl R. (1998). Mac-2 binding protein is a cell-adhesive protein of the extracellular matrix which self-assembles into ring-like structures and binds beta1 integrins, collagens and fibronectin. EMBO J. 17: 1606—1613. PMID 9501082 DOI:10.1093/emboj/17.6.1606
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6153 (англ.) . Архів оригіналу за 25 травня 2017. Процитовано 30 січня 2017.
- ↑ UniProt, P05556 (англ.) . Архів оригіналу за 27 березня 2017. Процитовано 30 січня 2017.
Див. також
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
Білки: кластери диференціації |
---|
| 1-50 | |
---|
| 51-100 | |
---|
| 101-150 | |
---|
| 151-200 | |
---|
| 201-250 | |
---|
| 251-300 | |
---|
| 301-350 | |
---|
|
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |