Гістон H1b

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2RHI

Ідентифікатори

Символи

H1-5, H1, H1.5, H1B, H1F5, H1s-3, histone cluster 1, H1b, histone cluster 1 H1 family member b, HIST1H1B, H1.5 linker histone, cluster member

Зовнішні ІД

OMIM: 142711 MGI: 1861461 HomoloGene: 136789 GeneCards: H1-5

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • histone deacetylase binding • chromatin DNA binding • RNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • double-stranded DNA binding • nucleosomal DNA binding
Клітинна компонента	• Нуклеосома • екзосома • хромосома • клітинне ядро
Біологічний процес	• establishment of protein localization to chromatin • nucleosome assembly • protein stabilization • positive regulation of cell growth • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • positive regulation of histone H3-K9 methylation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • chromosome condensation • negative regulation of DNA recombination • muscle organ development
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


3009


56702

Ensembl


ENSG00000184357


ENSMUSG00000058773

UniProt


P16401


P43276

RefSeq (мРНК)


NM_005322


NM_020034

RefSeq (білок)


NP_005313


NP_064418

Локус (UCSC)

Хр. 6: 27.87 – 27.87 Mb

Хр. 13: 21.96 – 21.96 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

Гістон H1b (англ. Histone cluster 1 H1 family member b) – білок, який кодується геном HIST1H1B, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 226 амінокислот, а молекулярна маса — 22 580^[4].

Представник родини білків гістонів H1.

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSETAPAETA	TPAPVEKSPA	KKKATKKAAG	AGAAKRKATG	PPVSELITKA
VAASKERNGL	SLAALKKALA	AGGYDVEKNN	SRIKLGLKSL	VSKGTLVQTK
GTGASGSFKL	NKKAASGEAK	PKAKKAGAAK	AKKPAGATPK	KAKKAAGAKK
AVKKTPKKAK	KPAAAGVKKV	AKSPKKAKAA	AKPKKATKSP	AKPKAVKPKA
AKPKAAKPKA	AKPKAAKAKK	AAAKKK

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

Albig W., Meergans T., Doenecke D. (1997). Characterization of the H1.5 gene completes the set of human H1 subtype genes. Gene. 184: 141—148. PMID 9031620 DOI:10.1016/S0378-1119(96)00582-3
Marzluff W.F., Gongidi P., Woods K.R., Jin J., Maltais L.J. (2002). The human and mouse replication-dependent histone genes. Genomics. 80: 487—498. PMID 12408966 DOI:10.1006/geno.2002.6850
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Parseghian M.H., Newcomb R.L., Winokur S.T., Hamkalo B.A. (2000). The distribution of somatic H1 subtypes is non-random on active vs. inactive chromatin: distribution in human fetal fibroblasts. Chromosome Res. 8: 405—424. PMID 10997781 DOI:10.1023/A:1009262819961
Parseghian M.H., Newcomb R.L., Hamkalo B.A. (2001). Distribution of somatic H1 subtypes is non-random on active vs. inactive chromatin II: distribution in human adult fibroblasts. J. Cell. Biochem. 83: 643—659. PMID 11746507 DOI:10.1002/jcb.1224
Th'ng J.P., Sung R., Ye M., Hendzel M.J. (2005). H1 family histones in the nucleus. Control of binding and localization by the C-terminal domain. J. Biol. Chem. 280: 27809—27814. PMID 15911621 DOI:10.1074/jbc.M501627200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4719 (англ.) . Архів оригіналу за 2 липня 2017. Процитовано 30 січня 2017.
↑ UniProt, P16401 (англ.) . Архів оригіналу за 16 листопада 2016. Процитовано 30 січня 2017.