Ro familija GTPaza

Ro familija GTPaza je familija malih (~21 kDa) signalnih G proteina (specifično ]GTPaza). Ona je potfamilija Ras superfamilije. Poznato je da članovi Ro GTPazne familije regulišu mnoge aspekte intracelularne aktinske dinamike. Oni su nađeni u svim eukariotskim organizmima, uključujući kvasce i neke biljke. Ova tri člana familije su bila detaljno studirana: Cdc42, Rac1, i RhoA. Ro proteini se smatraju "molekulskim prekidačima". Oni učestvuju u ćelijskoj proliferaciji, apoptozi, ekspresiji gena, i mnogobrojnim drugim ćelijskim funkcijama[1][2].

Istorija

Identifikacija Ro familije GTPaza je počela sredinom 1980-tih. Prvi identifikovani član Ro familije je bio RhoA, izolovan slučajno 1985 putem cDNK testiranja male oštrine.[3] Rac1 i Rac2 su zatim bili identifikovani 1989. godine[4], čemu je sledio Cdc42 1990.[5]. Osam dodatnih sisarskih Ro članova je bilo identifikovano biološkim testiranjem do kasnih 1990-ih, prekretne tačke u biologiji gde je dostupnost kompletne sekvence genoma omogućila potpunu identifikaciju genskih familija. Kod sisara, Ro familija sadrži 20 članova koji se svrstavaju u osam potfamilija: Ro, Rnd, RhoD/F, RhoH, Rac, Cdc42, RhoU/V i RhoBTB[1]

Paterson et al. su počeli sa ubrizgavanjem rekombinantnih ro proteina u švajcarske 3T3 ćelije 1990.[6]. Sredinom 1990-ih, procesi i efekti ro proteina su primećeni kod fibroblasta. Dr. Alan Hal, jedan od lidera u istraživanjima ro proteina, je objavio 1998. dokaze kojima je pokazao da nisu samo fibroblasti formirani procesima baziranim na ro aktivaciji, nego virtualno sve eukariotske ćelije[7]. U pregledu iz 2006. Bement et al. su objavili prostorne zone ro aktivacije.[8]

Kategorizacija

Ro familija GTPaza pripada superfamiliji Ras-sličnih proteina, koja se kod sisara sastoji od preko 150 varijanti. Ro familija se sastoji od 20 članova[1].

Vidi još

  • Inhibitor Ro protein GDP disocijacije

Literatura

  • Nicholas C. Price, Lewis Stevens (1999). Fundamentals of Enzymology: The Cell and Molecular Biology of Catalytic Proteins (Third izd.). USA: Oxford University Press. ISBN 019850229X. 
  • Eric J. Toone (2006). Advances in Enzymology and Related Areas of Molecular Biology, Protein Evolution (Volume 75 izd.). Wiley-Interscience. ISBN 0471205036. 
  • Branden C, Tooze J.. Introduction to Protein Structure. New York, NY: Garland Publishing. ISBN: 0-8153-2305-0. 
  • Irwin H. Segel. Enzyme Kinetics: Behavior and Analysis of Rapid Equilibrium and Steady-State Enzyme Systems (Book 44 izd.). Wiley Classics Library. ISBN 0471303097. 
  • Robert A. Copeland (2013). Evaluation of Enzyme Inhibitors in Drug Discovery: A Guide for Medicinal Chemists and Pharmacologists (2nd izd.). Wiley-Interscience. ISBN 111848813X. 
  • Gerhard Michal, Dietmar Schomburg (2012). Biochemical Pathways: An Atlas of Biochemistry and Molecular Biology (2nd izd.). Wiley. ISBN 0470146842. 
  1. 1,0 1,1 1,2 Boureux A, Vignal E, Faure S, Fort P. (2007). „Evolution of the Rho family of ras-like GTPases in eukaryotes”. Mol Biol Evol 24 (1): 203–16. DOI:10.1093/molbev/msl145. PMC 2665304. PMID 17035353.  Greška u referenci: Nevaljana oznaka <ref>; naziv "Boureux" je zadan više puta s različitim sadržajem
  2. Bustelo XR, Sauzeau V, Berenjeno IM. (2007). „GTP-binding proteins of the Rho/Rac family: regulation, effectors and functions in vivo.”. Bioessays 29 (4): 356–370. DOI:10.1002/bies.20558. PMC 1971132. PMID 17373658. 
  3. Madaule P., Axel R. (1985). „A novel ras-related gene family”. Cell 41 (1): 31–40. DOI:10.1016/0092-8674(85)90058-3. PMID 3888408. 
  4. Didsbury J, Weber RF, Bokoch GM, Evans T, Snyderman R. (1989). „Rac, a novel ras-related family of proteins that are botulinum toxin substrates.”. J Biol Chem 264 (28): 16378–82. ISSN 0021-9258. PMID 2674130. 
  5. Munemitsu S, Innis M, Clark R, McCormick F, Ullrich A, Polakis P. (1990). „Molecular cloning and expression of a G25K cDNA, the human homolog of the yeast cell cycle gene CDC42”. Mol Cell Biol 10 (11): 5977–82. ISSN 0270-7306. PMC 361395. PMID 2122236. 
  6. Paterson HF, Self AJ, Garrett MD, Just I, Aktories K, Hall A. (1990). „Microinjection of recombinant p21 rho induces rapid changes in cell morphology”. J Cell Biol 111 (3): 1001–7. DOI:10.1083/jcb.111.3.1001. PMC 2116288. PMID 2118140. 
  7. Hall A. (1998). „Rho GTPases and the actin cytoskeleton”. Science 279 (5350): 509–14. DOI:10.1126/science.279.5350.509. PMID 9438836. 
  8. Bement WM, Miller AL, von Dassow G. (2006). „Rho GTPase activity zones and transient contractile arrays”. Bioessays 28 (10): 983–93. DOI:10.1002/bies.20477. PMID 16998826. 
  • p
  • r
  • u
3.6.1
Pirofosfataza (Neorganska, Tiamin Apiraza  Tiamin trifosfataza
3.6.23.6.3-4: ATPaza
3.6.3
Cu++ (3.6.3.4)
Menkes/ATP7A  Vilson/ATP7B
Ca+ (3.6.3.8)
SERCA (ATP2A1, ATP2A2, ATP2A3)  Membrana plazme (ATP2B1, ATP2B2, ATP2B3, ATP2B4)  SPCA (ATP2C1, ATP2C2)
Na+/K+ (3.6.3.9)
ATP1A1  ATP1A2  ATP1A3  ATP1A4  ATP1B1  ATP1B2  ATP1B3  ATP1B4
H+/K+ (3.6.3.10)
ATP4A
Druge P-tip ATPaze
ATP8B1  ATP10A  ATP11B  ATP12A  ATP13A2  ATP13A3 
3.6.4
Dinein  Kinezin  Miozin
3.6.5: GTPaze
Gαs  Gαi (GNAI1, GNAI2, GNAI3 Gαq/11 (GNAQ, GNA11 Gα12/13 (GNA12, GNA13 Transducin (GNAT1, GNAT2)
Ras  Rab (Rab27)  Arf (Arf6)  Ran  Rheb  Ro familija (RhoA, RhoB, CDC42, Rac1)  Rap
3.6.5.3: Protein-sintetišuće GTPaze
Prokariotski (IF-2, EF-Tu, EF-G Eukariotski
3.6.5.5-6: Polimerizacioni motori
B enzm: 1.1/2/3/4/5/6/7/8/10/11/13/14/15-18, 2.1/2/3/4/5/6/7/8, 2.7.10, 2.7.11-12, 3.1/2/3/4/5/6/7, 3.1.3.48, 3.4.21/22/23/24, 4.1/2/3/4/5/6, 5.1/2/3/4/99, 6.1-3/4/5-6
  • p
  • r
  • u
Teme
Tipovi
EC1 Oksidoreduktaze/spisak  • EC2 Transferaze/spisak  • EC3 Hidrolaze/spisak  • EC4 Lijaze/spisak  • EC5 Izomeraze/spisak  • EC6 Ligaze/spisak
B enzm: 1.1/2/3/4/5/6/7/8/10/11/13/14/15-18, 2.1/2/3/4/5/6/7/8, 2.7.10, 2.7.11-12, 3.1/2/3/4/5/6/7, 3.1.3.48, 3.4.21/22/23/24, 4.1/2/3/4/5/6, 5.1/2/3/4/99, 6.1-3/4/5-6