ITGAM

ITGAM
Structures disponibles
PDBRecherche d'orthologue: PDBe RCSB
Identifiants PDB

1BHO, 1BHQ, 1IDN, 1IDO, 1JLM, 1M1U, 1MF7, 1N9Z, 1NA5, 2LKE, 2LKJ, 3Q3G, 3QA3, 4M76, 4XW2

Identifiants
AliasesITGAM
IDs externesOMIM: 120980 MGI: 96607 HomoloGene: 526 GeneCards: ITGAM
Position du gène (Homme)
Chromosome 16 humain
Chr.Chromosome 16 humain[1]
Chromosome 16 humain
Localisation génomique pour ITGAM
Localisation génomique pour ITGAM
Locus16p11.2Début31,259,967 bp[1]
Fin31,332,892 bp[1]
Position du gène (Souris)
Chromosome 7 (souris)
Chr.Chromosome 7 (souris)[2]
Chromosome 7 (souris)
Localisation génomique pour ITGAM
Localisation génomique pour ITGAM
Locus7|7 F3Début127,661,812 bp[2]
Fin127,717,663 bp[2]
Expression génétique
Bgee
HumainSouris (orthologue)
Fortement exprimé dans
  • monocyte

  • granulocyte

  • os spongieux

  • moelle osseuse

  • sang

  • cellule de la moelle osseuse

  • rate

  • appendice iléo-cæcal

  • upper lobe of left lung

  • Caduque basale
Fortement exprimé dans
  • granulocyte

  • moelle osseuse

  • iléon

  • Jéjunum

  • rate

  • dentate gyrus of hippocampal formation granule cell

  • hippocampus proper

  • œsophage

  • striatum of neuraxis

  • utérus
Plus de données d'expression de référence
BioGPS
Plus de données d'expression de référence
Gene Ontology
Fonction moléculaire
  • liaison ion métal
  • liaison protéique
  • protein heterodimerization activity
  • heat shock protein binding
  • amyloid-beta binding
  • complement component C3b binding
  • cargo receptor activity
Composant cellulaire
  • exosome
  • membrane plasmique
  • surface cellulaire
  • membrane
  • integral component of membrane
  • integrin complex
  • milieu extracellulaire
  • specific granule membrane
  • tertiary granule membrane
  • external side of plasma membrane
  • integrin alphaM-beta2 complex
  • plasma membrane raft
  • radeau lipidique
Processus biologique
  • ectodermal cell differentiation
  • toll-like receptor 4 signaling pathway
  • integrin-mediated signaling pathway
  • leukocyte migration
  • extracellular matrix organization
  • adhésion cellulaire
  • neutrophil degranulation
  • microglial cell activation
  • processus du système immunitaire
  • endocytose à récepteur
  • phagocytosis, engulfment
  • cytokine-mediated signaling pathway
  • positive regulation of superoxide anion generation
  • positive regulation of neutrophil degranulation
  • système immunitaire inné
  • negative regulation of dopamine metabolic process
  • positive regulation of protein targeting to membrane
  • amyloid-beta clearance
  • cell-cell adhesion via plasma-membrane adhesion molecules
  • complement-mediated synapse pruning
  • vertebrate eye-specific patterning
  • positive regulation of neuron death
  • positive regulation of microglial cell activation
  • positive regulation of microglial cell mediated cytotoxicity
  • cell surface receptor signaling pathway involved in cell-cell signaling
  • positive regulation of prostaglandin-E synthase activity
  • forebrain development
  • apoptotic signaling pathway
  • positive regulation of hippocampal neuron apoptotic process
Sources:Amigo / QuickGO
Orthologues
EspècesHommeSouris
Entrez

3684

16409

Ensembl

ENSG00000169896

ENSMUSG00000030786

UniProt

P11215

P05555

RefSeq (mRNA)

NM_000632
NM_001145808

NM_001082960
NM_008401

RefSeq (protéine)

NP_000623
NP_001139280

n/a

Localisation (UCSC)Chr 16: 31.26 – 31.33 MbChr 7: 127.66 – 127.72 Mb
Publication PubMed[3][4]
Wikidata
Voir/Editer HumainVoir/Editer Souris

L'ITGAM (pour « Integrin alpha M »), ou CD11B est une protéine de type intégrine et cluster de différenciation. Son gène est ITGAM porté sur le chromosome 16 humain.

Rôles

Il forme, avec le CD18, le Mac-1 (« Macrophage-1 antigen »). Il inhibe le signal des récepteurs de type Toll par l'intermédiaire de l'activation du SYK et du Src[5]. Il contribue au phénomène de tolérance (immunologie) par les lymphocytes B en inhibant son récepteur[6].

En médecine

Plusieurs variants du gène est corrélé avec une augmentation du risque de survenue d'un lupus érythémateux disséminé[7]. Il entraîne alors une dysfonction du Mac-1 au niveau des polynucléaires neutrophiles[8], altérant l'adhésion cellulaire par l'ICAM-1 et 2[9]. Un variant du gène augmente plus spécifiquement le risque d'atteinte rénale et de rash de type discoïde[10].

Notes et références

  1. a b et c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000169896 - Ensembl, May 2017
  2. a b et c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000030786 - Ensembl, May 2017
  3. « Publications PubMed pour l'Homme », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  4. « Publications PubMed pour la Souris », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  5. Han C, Jin J, Xu S, Liu H, Li N, Cao X, Integrin CD11b negatively regulates TLR-triggered inflammatory responses by activating Syk and promoting degradation of MyD88 and TRIF via Cbl-b, Nat Immunol, 2010;11:734–742
  6. Ding C, Ma Y, Chen X et al. Integrin CD11b negatively regulates BCR signalling to maintain autoreactive B cell tolerance, Nat Commun, 2013;4:2813
  7. International Consortium for Systemic Lupus Erythematosus Genetics (SLEGEN) et al. Genome-wide association scan in women with systemic lupus erythematosus identifies susceptibility variants in ITGAM, PXK, KIAA1542 and other loci, Nat Genet, 2008;40:204–210
  8. Zhou Y, Wu J, Kucik DF et al. Multiple lupus-associated ITGAM variants alter Mac-1 functions on neutrophils, Arthritis Rheum, 2013;65:2907–2916
  9. MacPherson M, Lek HS, Prescott A, Fagerholm SC, A systemic lupus erythematosus-associated R77H substitution in the CD11b chain of the Mac-1 integrin compromises leukocyte adhesion and phagocytosis, J Biol Chem. 2011;286:17303–17310
  10. Kim-Howard X, Maiti AK, Anaya JM et al. ITGAM coding variant (rs1143679) influences the risk of renal disease, discoid rash and immunological manifestations in patients with systemic lupus erythematosus with European ancestry, Ann Rheum Dis, 2010;69:1329–1332
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